RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CROCCP2Q86T23 111 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP57Q86XR8 500 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H7C4K7 107 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFEMP2O95967 443 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLTBP09497 229 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HCAR3P49019 387 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GBE1Q04446 702 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPYSQ14117 519 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.222e-6■■■■□ 21.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.66■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHBGP04278 402 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMPD1P23109 780 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAC4Q86UU9 113 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP93Q8N1F7 819 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPT1BQ92523 772 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OLFM3Q96PB7 478 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.224e-6■■■■□ 22.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DTLQ9NZJ0 730 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCML2Q9UQR0 700 aa22.65■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 I6L893 689 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DGKIO75912 1065 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR17Q13304 367 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFX8Q6ZV50 586 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PWWP2AQ96N64 755 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDCPQ9H6R7 721 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM51Q9NW97 253 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL37Q9NZH6 218 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAK5Q9P286 719 aa22.64■■□□□ 1.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.64■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HACD1B0YJ81 288 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNN4O15554 427 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBL1P28749 1068 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT71Q3SY84 523 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTP2Q5QGT7 225 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMC10Q5UCC4 262 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C4orf22Q6V702 233 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCD5Q86SK9 330 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B3GALT6Q96L58 329 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTPALQ9BTX7 342 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACTN2P35609 894 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CWH43Q9H720 699 aa22.63■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM92AA1XBS5 289 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCLK1O15075 740 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRAK2O43187 625 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CREB3O43889 395 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PBX3P40426 434 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD16Q68DU8 428 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MON1AQ86VX9 555 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGM2Q96G03 612 aa22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR11A4FU01 709 aa22.61■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMHP03971 560 aa22.61■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPB1P15086 417 aa22.61■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEA4P43358 317 aa22.61■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KYNUQ16719 465 aa22.61■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDR2Q16832 855 aa22.61■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.61■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CENPUQ71F23 418 aa22.61■■□□□ 1.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms