RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 CTSHP09668 335 aa18.2■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.2■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.2■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 GGA3Q9NZ52 723 aa18.2■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF212Q9UDV6 495 aa18.2■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 WNT10BO00744 389 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 FAM200BP0CF97 657 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 HDAC4P56524 1084 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MON1BQ7L1V2 547 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM79Q9BSE2 394 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 SPON2Q9BUD6 331 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM165Q9HC07 324 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 DPP3Q9NY33 737 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 LACTBL1A8MY62 500 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 VWA5AO00534 786 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PDK3Q15120 406 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ARL13BQ3SXY8 428 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 SEL1L3Q68CR1 1132 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 RTKN2Q8IZC4 609 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 CYLDQ9NQC7 956 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PPM1HQ9ULR3 514 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PSMC3P17980 439 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 CDKN2BP42772 138 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 RABGGTBP53611 331 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 CXCL9Q07325 125 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ATP1A4Q13733 1029 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MAGEC3Q8TD91 643 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 HACL1Q9UJ83 578 aa18.19■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PIGNO95427 931 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC130P13994 396 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PSMB4P28070 264 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 TUBP50607 506 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PARP8Q8N3A8 854 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 BEST2Q8NFU1 509 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 HASPINQ8TF76 798 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MYPNQ86TC9 1320 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ALADP13716 330 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 IL1R2P27930 398 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 NCKAP1LP55160 1127 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 OGDHQ02218 1023 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 SEPHS2Q99611 448 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MYH11P35749 1972 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 RNF103O00237 685 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 GPRASP2Q96D09 838 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PPCSQ9HAB8 311 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 CAPSQ13938 189 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 DLG2Q15700 870 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 RNF139Q8WU17 664 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 FAM167AQ96KS9 214 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MYH3P11055 1940 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 GPX6P59796 221 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MPP3Q13368 585 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 NEDD8Q15843 81 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 SATL1Q86VE3 508 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM109Q9BVC6 243 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC134Q9H6E4 229 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 MID2Q9UJV3 735 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ERBB2P04626 1255 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF286BP0CG31 522 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 UNGP13051 313 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 GALK1P51570 392 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 OLIG2Q13516 323 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 FAXDC2Q96IV6 333 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 VPS50Q96JG6 964 aa18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NOMO3-201ENST00000263012 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.5 ms