RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438265.5

RPE-211, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 3

Gene RPE, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-211ENST00000438265 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 TMEM270Q6UE05 265 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 SYT13Q7L8C5 426 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 MIB1Q86YT6 1006 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 ZNF276Q8N554 614 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 IQCDQ96DY2 449 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 SIX2Q9NPC8 291 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CYLDQ9NQC7 956 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 111.8
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RPE-211ENST00000438265 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 WASF3Q9UPY6 502 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.7□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 A0A1B0GTH6 734 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 A0A1W2PQC6 194 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 LNP1A1A4G5 178 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 O00370 1275 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 COCHO43405 550 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 UCHL3P15374 230 aa8.69□□□□□ -1.02
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RPE-211ENST00000438265 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 PLA2G4AP47712 749 aa8.69□□□□□ -1.02
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RPE-211ENST00000438265 ZNF445P59923 1031 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 SLC7A9P82251 487 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 KDSRQ06136 332 aa8.69□□□□□ -1.02
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RPE-211ENST00000438265 PMS2CLQ68D20 193 aa8.69□□□□□ -1.02
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RPE-211ENST00000438265 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.69□□□□□ -1.02
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RPE-211ENST00000438265 C12orf29Q8N999 325 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 ATP2A3Q93084 1043 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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RPE-211ENST00000438265 CBX8Q9HC52 389 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CD248Q9HCU0 757 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 OSER1Q9NX31 292 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 MYO6Q9UM54 1294 aa8.69□□□□□ -1.02
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RPE-211ENST00000438265 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 C4orf47A7E2U8 309 aa8.68□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 HHLA1C9JL84 531 aa8.68□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 MDM4O15151 490 aa8.68□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 KCNK5O95279 499 aa8.68□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 APBB3O95704 486 aa8.68□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 TBX18O95935 607 aa8.68□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 ABL1P00519 1130 aa8.68□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 TPM3P06753 285 aa8.68□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.68□□□□□ -1.02
RPE-211ENST00000438265 CD19P15391 556 aa8.68□□□□□ -1.02
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