RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428585.5

CARF-208, Transcript of calcium responsive transcription factor, human

TSL 2 BASIC

Gene CARF, Length 2,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CARF-208	ENST00000428585	KIF11	P52732	1056 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	GRIK5	Q16478	980 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CRY1	Q16526	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PODXL	O00592	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CCDC175	P0C221	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	AOC1	P19801	751 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ADORA2A	P29274	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	GSTM4	Q03013	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	HID1	Q8IV36	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	EID2B	Q96D98	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	COG8	Q96MW5	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	FAM205C	A6NFA0	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	FMO6P	O60774	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	BEST1	O76090	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MX1	P20591	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DPP6	P42658	865 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RNF4	P78317	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	HYAL1	Q12794	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	NFIA	Q12857	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	BICD1	Q96G01	975 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RAD9A	Q99638	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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