RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NCF4Q15080 339 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PARP10Q53GL7 1025 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 APPL2Q8NEU8 664 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SPATA18Q8TC71 538 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ACAD9Q9H845 621 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ADRA1DP25100 572 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KCNK10P57789 538 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 BICRALQ6AI39 1079 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 OR8H3Q8N146 312 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 VPS33AQ96AX1 596 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HPS4Q9NQG7 708 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GNA15P30679 374 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ITGA1P56199 1179 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC157Q569K6 752 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CCNYQ8ND76 341 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 POTEMA6NI47 508 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CLPXO76031 633 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GH1P01241 217 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 BMP6P22004 513 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HADHAP40939 763 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KCNA1Q09470 495 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PRKG1Q13976 671 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM32Q13049 653 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TAF5Q15542 800 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC24Q50LG9 513 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CYP4X1Q8N118 509 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TASP1Q9H6P5 420 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 COMMD8Q9NX08 183 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ADGRB3O60242 1522 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GABBR2O75899 941 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 UFL1O94874 794 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF284Q2VY69 593 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 POTEHQ6S545 545 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 BNIPLQ7Z465 357 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HES6Q96HZ4 224 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RUBCNLQ9H714 662 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NTRK1P04629 796 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AKAP5P24588 427 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GRIK1P39086 918 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC18A1P54219 525 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 COX10Q12887 443 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NME3Q13232 169 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM228AQ86W67 206 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SP140LQ9H930 580 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GSTT2P0CG29 244 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GSTT2BP0CG30 244 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PRKAR1AP10644 381 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FECHP22830 423 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC25A3Q00325 362 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RELAQ04206 551 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MND1Q9BWT6 205 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EMSYQ7Z589 1322 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PP2D1A8MPX8 630 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PDE8BO95263 885 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.63□□□□□ -1.35
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