RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 ACADSBP45954 432 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 SEMA5AQ13591 1074 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 WASHC2DQ5SRD0 308 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 ZNF534Q76KX8 674 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 TBC1D31Q96DN5 1066 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 STK38LQ9Y2H1 464 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 FAM159BA6NKW6 160 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 A8MUI8 341 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 HACD1B0YJ81 288 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 E7ENQ6 273 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 NPTXRO95502 500 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 MMP3P08254 477 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 SERPINB4P48594 390 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 STRADAQ7RTN6 431 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 VPS52Q8N1B4 723 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 GIMAP7Q8NHV1 300 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 SKA1Q96BD8 255 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 HAO1Q9UJM8 370 aa25.96■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 KAT6AQ92794 2004 aa25.95■■□□□ 1.75
ROM1-201ENST00000278833 GOLGA8RI6L899 631 aa25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 PYGBP11216 843 aa25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 ELF1P32519 619 aa25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 SERPINB9P50453 376 aa25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 HSFY1Q96LI6 401 aa25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 ADAM33Q9BZ11 813 aa25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 HEY1Q9Y5J3 304 aa25.95■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 PIK3R2O00459 728 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 COPEO14579 308 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 ANP32DO95626 131 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 MLNP12872 115 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 CDK16Q00536 496 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 KRT72Q14CN4 511 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 C9orf57Q5W0N0 161 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 STEAP4Q687X5 459 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 TIFABQ6ZNK6 161 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 RFWD2Q8NHY2 731 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 GSDMBQ8TAX9 411 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 CFAP36Q96G28 342 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 SIGLEC10Q96LC7 697 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 FAM111AQ96PZ2 611 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
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ROM1-201ENST00000278833 CPA4Q9UI42 421 aa25.94■■□□□ 1.74
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ROM1-201ENST00000278833 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
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ROM1-201ENST00000278833 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 CNTFP26441 200 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 AXLP30530 894 aa25.94■■□□□ 1.74
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ROM1-201ENST00000278833 HACE1Q8IYU2 909 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 C7orf26Q96N11 449 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 OLFM3Q96PB7 478 aa25.94■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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ROM1-201ENST00000278833 A6NJR5 290 aa25.93■■□□□ 1.74
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ROM1-201ENST00000278833 CD4P01730 458 aa25.93■■□□□ 1.74
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ROM1-201ENST00000278833 L3MBTL1Q9Y468 752 aa25.93■■□□□ 1.74
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ROM1-201ENST00000278833 GPR32O75388 356 aa25.92■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 PIAS1O75925 651 aa25.92■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 ARFIP2P53365 341 aa25.92■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 XKR4Q5GH76 650 aa25.92■■□□□ 1.74
ROM1-201ENST00000278833 UNC5AQ6ZN44 842 aa25.92■■□□□ 1.74
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