RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411660.1

RPS3AP25-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP25, Length 793 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP25-201ENST00000411660 KIF1BO60333 1816 aa6.03□□□□□ -1.44
RPS3AP25-201ENST00000411660 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.03□□□□□ -1.44
RPS3AP25-201ENST00000411660 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RPS3AP25-201ENST00000411660 CLTCL1P53675 1640 aa6.03□□□□□ -1.44
RPS3AP25-201ENST00000411660 ADGRB2O60241 1585 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 MARCH6O60337 910 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PDE8BO95263 885 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TUBB4AP04350 444 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSPY4P0CV99 314 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSPY10P0CW01 314 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CYP2D6P10635 497 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 KELP23276 732 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 MPGP29372 298 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRKAG1P54619 331 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 BCAT1P54687 386 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CCNIQ14094 377 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CEP78Q5JTW2 689 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF626Q68DY1 528 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 FCRL6Q6DN72 434 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TERB1Q8NA31 727 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 RITA1Q96K30 269 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRR25Q96S07 402 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 KIF1AQ12756 1690 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CFAP69A5D8W1 941 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 HRGP04196 525 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 EPHB2P29323 1055 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 E2F1Q01094 437 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 NPY5RQ15761 445 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPSB4Q96A44 273 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 ASB2Q96Q27 587 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.01□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 DAPK1P53355 1430 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 AP4M1O00189 453 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 GKP32189 559 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 MLC1Q15049 377 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CNGA2Q16280 664 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 INSCQ1MX18 579 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC18B1Q6NT16 456 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPARTQ8N0X7 666 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CTHRC1Q96CG8 243 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM204AQ9H8W3 233 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 RGPD5Q99666 1765 aa6□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 KNDC1Q76NI1 1749 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 AKAP12Q02952 1782 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TP73O15350 636 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 CCP110O43303 1012 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSPAN6O43657 245 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 EXOC3O60645 756 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PMPCBO75439 489 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 FGAP02671 866 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 FPR3P25089 353 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 KLRC1P26715 233 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 UQCRC1P31930 480 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 RENBPP51606 427 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 PSG6Q00889 435 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 FMO1Q01740 532 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 MORN5Q5VZ52 161 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 GALNT16Q8N428 558 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS3AP25-201ENST00000411660 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms