RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 SLC39A12Q504Y0 691 aa29.11■■■□□ 2.25
CCZ1-201ENST00000325974 SLC9A4Q6AI14 798 aa29.11■■■□□ 2.25
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CCZ1-201ENST00000325974 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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CCZ1-201ENST00000325974 ANAPC5Q9UJX4 755 aa29.11■■■□□ 2.25
CCZ1-201ENST00000325974 USP3Q9Y6I4 520 aa29.11■■■□□ 2.25
CCZ1-201ENST00000325974 APOL1O14791 398 aa29.1■■■□□ 2.25
CCZ1-201ENST00000325974 MCF2LO15068 1137 aa29.1■■■□□ 2.25
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CCZ1-201ENST00000325974 ETS1P14921 441 aa29.08■■■□□ 2.25
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CCZ1-201ENST00000325974 P3H1Q32P28 736 aa29.08■■■□□ 2.25
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CCZ1-201ENST00000325974 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
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CCZ1-201ENST00000325974 NFS1Q9Y697 457 aa29.08■■■□□ 2.25
CCZ1-201ENST00000325974 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
CCZ1-201ENST00000325974 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa29.08■■■□□ 2.25
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CCZ1-201ENST00000325974 RARGP13631 454 aa29.08■■■□□ 2.25
CCZ1-201ENST00000325974 CTXN3Q4LDR2 81 aa29.08■■■□□ 2.25
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CCZ1-201ENST00000325974 COX16Q9P0S2 106 aa29.08■■■□□ 2.25
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CCZ1-201ENST00000325974 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.07■■■□□ 2.24
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CCZ1-201ENST00000325974 C10orf88Q9H8K7 445 aa29.07■■■□□ 2.24
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CCZ1-201ENST00000325974 TNFRSF10BO14763 440 aa29.06■■■□□ 2.24
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CCZ1-201ENST00000325974 CSPG4P5Q96PW8 444 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 TRIM62Q9BVG3 475 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 EPB41L4BQ9H329 900 aa29.06■■■□□ 2.24
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CCZ1-201ENST00000325974 SLC5A3P53794 718 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 ROR1Q01973 937 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 BEND5Q7L4P6 421 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 UNC45BQ8IWX7 931 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 PYROXD2Q8N2H3 581 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 EDEM1Q92611 657 aa29.06■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 CLTBP09497 229 aa29.05■■■□□ 2.24
CCZ1-201ENST00000325974 CHKAP35790 457 aa29.05■■■□□ 2.24
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