RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	BPIFB4	P59827	614 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	PTK2	Q05397	1052 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE4C	Q08493	712 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ADIG	Q0VDE8	80 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CCIN	Q13939	588 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	DHCR24	Q15392	516 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	STX1A	Q16623	288 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	SDE2	Q6IQ49	451 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	UBA3	Q8TBC4	463 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	HSFY1	Q96LI6	401 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	DEC1	Q9P2X7	70 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	NCDN	Q9UBB6	729 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	HHLA1	C9JL84	531 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246		O00370	1275 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPN9	O14815	690 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	THAP12	O43422	761 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF40	O75150	1001 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ALDH1A2	O94788	518 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	GNA15	P30679	374 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF445	P59923	1031 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP68	Q76N32	757 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MED15	Q96RN5	788 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.89	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	EGF	P01133	1207 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP17A1	P05093	508 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT9	P35527	623 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	GRIA2	P42262	883 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MEA1	Q16626	185 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	BBS2	Q9BXC9	721 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MIS12	Q9H081	205 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246		R4GN57	208 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR23A	A6NEV1	266 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TBX18	O95935	607 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	HMBS	P08397	361 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFRSF4	P43489	277 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	RGS7	P49802	495 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TPM4	P67936	248 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SATB1	Q01826	763 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ARID5A	Q03989	594 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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