RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 FZD5Q13467 585 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 SYCP1Q15431 976 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.232e-24■□□□□ 9.3
ACTB-206ENST00000443528 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 FAM3CQ92520 227 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 STK33Q9BYT3 514 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 CBX8Q9HC52 389 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 E2F8A0AVK6 867 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 E7ENQ6 273 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 GREM1O60565 184 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 RALAP11233 206 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 IFNAR2P48551 515 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 UBXN1Q04323 297 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 WDTC1Q8N5D0 677 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 STK32AQ8WU08 396 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 MSANTD3Q96H12 275 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 NELL2Q99435 816 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 OSBPL6Q9BZF3 934 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 NACA2Q9H009 215 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 ECT2Q9H8V3 914 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.5■□□□□ 0.23
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ACTB-206ENST00000443528 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 F8VZ95 297 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 TEX33O43247 280 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 IRF1P10914 325 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 NFKBIBQ15653 356 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 LUZP1Q86V48 1076 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 ATP2A3Q93084 1043 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 CYP11B1P15538 503 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 GJA4P35212 333 aa16.48■□□□□ 0.23
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ACTB-206ENST00000443528 BPIFB4P59827 614 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 EFEMP1Q12805 493 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 HTR3DQ70Z44 454 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 TADA2BQ86TJ2 420 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 MIB1Q86YT6 1006 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 PASD1Q8IV76 773 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 CPA6Q8N4T0 437 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 PRSS33Q8NF86 280 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 IRGQQ8WZA9 623 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
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ACTB-206ENST00000443528 MIS12Q9H081 205 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 LHX5Q9H2C1 402 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 ST7Q9NRC1 585 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 TJP2Q9UDY2 1190 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.48■□□□□ 0.23
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ACTB-206ENST00000443528 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 FBXO21O94952 628 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 NFATC1O95644 943 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 CYP17A1P05093 508 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 KRT9P35527 623 aa16.47■□□□□ 0.23
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ACTB-206ENST00000443528 NUBP1P53384 320 aa16.47■□□□□ 0.23
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ACTB-206ENST00000443528 PON2Q15165 354 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 GAB4Q2WGN9 574 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 C1orf228Q6PIY5 440 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 TMEM110Q86TL2 294 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 BBS7Q8IWZ6 715 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 DTWD2Q8NBA8 298 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 NEK11Q8NG66 645 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 EDEM1Q92611 657 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 KCNH6Q9H252 994 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 RASAL2Q9UJF2 1139 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-206ENST00000443528 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.47■□□□□ 0.23
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