RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	YBR027C	P38220	110 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	YPR153W	Q06537	140 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	YPR195C	Q06594	109 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	SDH6	Q3E785	79 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	HUB1	Q6Q546	73 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	YDL012C	Q12489	107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	OST5	Q92316	86 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PSH1	YOL054W	LCL1	Q02786	101 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PSH1	YOL054W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PSH1	YOL054W	YDR010C	Q12426	110 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PSH1	YOL054W	YGL034C	P53186	121 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PSH1	YOL054W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PSH1	YOL054W	MMS2	P53152	137 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PSH1	YOL054W	LCL2	Q08045	131 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PSH1	YOL054W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PSH1	YOL054W	YLR255C	O13574	117 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PSH1	YOL054W	YJR128W	P47162	119 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PSH1	YOL054W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PSH1	YOL054W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PSH1	YOL054W	YGL149W	P53116	101 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PSH1	YOL054W	COX8	P04039	78 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PSH1	YOL054W	ATP17	Q06405	101 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PSH1	YOL054W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PSH1	YOL054W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PSH1	YOL054W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PSH1	YOL054W	COX7	P10174	60 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	YBR016W	P38216	128 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	MRX7	P53869	86 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	OLI1	P61829	76 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	YJL144W	P47009	104 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	FYV12	Q08559	129 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PSH1	YOL054W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		3.27	□□□□□ -1.89
PSH1	YOL054W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PSH1	YOL054W	QCR10	P37299	77 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PSH1	YOL054W	YEL014C	P39999	101 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PSH1	YOL054W	YCR108C	Q3E819	63 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSH1	YOL054W	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PSH1	YOL054W	YBL044W	P38194	122 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PSH1	YOL054W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PSH1	YOL054W	SOM1	Q05676	74 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PSH1	YOL054W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PSH1	YOL054W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PSH1	YOL054W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		2.97	□□□□□ -1.93
PSH1	YOL054W	YJL009W	P47078	108 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PSH1	YOL054W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PSH1	YOL054W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PSH1	YOL054W	YDR210W	Q03482	75 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PSH1	YOL054W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		2.84	□□□□□ -1.95
PSH1	YOL054W	HHY1	P39982	102 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PSH1	YOL054W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PSH1	YOL054W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
PSH1	YOL054W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		2.24	□□□□□ -2.05
PSH1	YOL054W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	2.12	□□□□□ -2.07
PSH1	YOL054W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		1.96	□□□□□ -2.1

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