RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W RPC10P40422 70 aa1.22□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YJR146WP47174 117 aa1.22□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W FYV12Q08559 129 aa1.22□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa1.22□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YFR009W-AP0C5M9 85 aa1.21□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YLR157W-DP0CE99 70 aa1.21□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YEL008WP40001 126 aa1.21□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YJL144WP47009 104 aa1.21□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W ATP17Q06405 101 aa1.21□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W SDH6Q3E785 79 aa1.21□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa1.21□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YDL241WQ07738 123 aa1.2□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W AQY2P0CD90 149 aa1.19□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YBR027CP38220 110 aa1.19□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YGL041C-BQ3E750 60 aa1.19□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YLL006W-AQ3E814 58 aa1.19□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YHR125WP38831 101 aa1.18□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa1.18□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YGL014C-AP0C5N1 53 aa1.17□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa1.17□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa1.16□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W Q0032Q9ZZX7 96 aa1.16□□□□□ -2.22
SSQ1YLR369W COX8P04039 78 aa1.15□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W YBL039W-BP0C268 59 aa1.15□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W YEL014CP39999 101 aa1.15□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W YAR064WP39563 99 aa1.14□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W YJL127C-BQ3E828 52 aa1.14□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W MVB12P42939 101 aa1.14□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W DDR2P89113 61 aa1.13□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W YDR210WQ03482 75 aa1.13□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W YBR230W-AQ3E762 66 aa1.13□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa1.12□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W YHR032W-AP0C5N6 59 aa1.11□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W COX7P10174 60 aa1.1□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W YOR072WQ08486 104 aa1.1□□□□□ -2.23
SSQ1YLR369W OLI1P61829 76 aa1.08□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YHR007C-AQ07074 71 aa1.08□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa1.08□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YLR255CO13574 117 aa1.08□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa1.08□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YJR128WP47162 119 aa1.06□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YBL044WP38194 122 aa1.05□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YJL009WP47078 108 aa1.04□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YHR086W-AQ3E746 53 aa1.04□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YOR316C-AQ3E806 69 aa1.04□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YCR108CQ3E819 63 aa1.04□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W YHR073W-AP0C5N7 58 aa1.03□□□□□ -2.24
SSQ1YLR369W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
SSQ1YLR369W YBR016WP38216 128 aa1.01□□□□□ -2.25
SSQ1YLR369W YBR072C-AQ3E794 53 aa1.01□□□□□ -2.25
SSQ1YLR369W Q0017Q9ZZX8 53 aa1.01□□□□□ -2.25
SSQ1YLR369W HHY1P39982 102 aa0.98□□□□□ -2.25
SSQ1YLR369W YOR072W-BQ3E832 53 aa0.97□□□□□ -2.25
SSQ1YLR369W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
SSQ1YLR369W YML054C-AQ3E809 52 aa0.9□□□□□ -2.27
SSQ1YLR369W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa0.86□□□□□ -2.27
SSQ1YLR369W YLR157W-EP0CF00 54 aa0.78□□□□□ -2.28
SSQ1YLR369W YHR050W-AQ05451 56 aa0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.4 ms