RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473565.5

CLK1-210, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLK1, Length 3,208 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-210ENST00000473565 CDK7P50613 346 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 GPS2Q13227 327 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 PTK6Q13882 451 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 KRT81Q14533 505 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 P3H1Q32P28 736 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ZNF365Q70YC5 407 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 EDEM1Q92611 657 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 RUFY1Q96T51 708 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 AAASQ9NRG9 546 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.51□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SGK1O00141 431 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 DNM1LO00429 736 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 GAS8O95995 478 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 CYP2C18P33260 490 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 PCK1P35558 622 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SULT1E1P49888 294 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ARSEP51690 589 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 GAD2Q05329 585 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 CALCOCO2Q13137 446 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 NME3Q13232 169 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 MREGQ8N565 214 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 FAM71BQ8TC56 605 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 MAIP1Q8WWC4 291 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ART4Q93070 314 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 DPYSL4O14531 572 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ENPP3O14638 875 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 UPP2O95045 317 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 FYNP06241 537 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 KLRC2P26717 231 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 PGFP49763 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SLC8A3P57103 927 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 GPS1Q13098 491 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 BBS12Q6ZW61 710 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 CEP57Q86XR8 500 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 PQLC3Q8N755 202 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SLCO2A1Q92959 643 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 LRRC45Q96CN5 670 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SNF8Q96H20 258 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 HSFY1Q96LI6 401 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 CDH9Q9ULB4 789 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 VWA8A3KMH1 1905 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 HHLA1C9JL84 531 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 H0YGN5 161 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 PPFIA2O75334 1257 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 BANF1O75531 89 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 CYP2F1P24903 491 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 COPS2P61201 443 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ZNF844Q08AG5 666 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ARHGEF6Q15052 776 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 TAZQ16635 292 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ALS2CLQ60I27 953 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 METTL23Q86XA0 190 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ALLCQ8N6M5 410 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 SPATA18Q8TC71 538 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms