RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 OSCP1Q8WVF1 389 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 RSPRY1Q96DX4 576 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 MFSD3Q96ES6 412 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PIMREGQ9BSJ6 248 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 DCLK3Q9C098 648 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PIF1Q9H611 641 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 SGTAO43765 313 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 ULK1O75385 1050 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 GNAI2P04899 355 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 RARBP10826 455 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 FCGR1AP12314 374 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 APEHP13798 732 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 CPA1P15085 419 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 LINC01465Q8N7H1 131 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAB24Q969Q5 203 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXO17Q96EF6 278 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIC2Q96JB3 615 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 UHRF2Q96PU4 802 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAB2Q9UQC2 676 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLEC18AA5D8T8 446 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR6C75A6NL08 312 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 GOLGA8AA7E2F4 631 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 M0QYG6 137 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 EDIL3O43854 480 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLAUP00749 431 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 GKP32189 559 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PMP22Q01453 160 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 DEPDC1Q5TB30 811 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM160B1Q5W0V3 765 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUGGCQ68CJ6 796 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTCHD4Q6ZW05 846 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPM1KQ8N3J5 372 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRR26Q8N8Z3 221 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLEC18CQ8NCF0 446 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 DPF2Q92785 391 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC46A1Q96NT5 459 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTYH3Q9C0H2 523 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCRT2Q9NQ03 307 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRO0461Q9UI25 63 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 INTUQ9ULD6 942 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 AGAP1Q9UPQ3 857 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 DTX4Q9Y2E6 619 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1W2PPC1 479 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 M0R3H8 397 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 TLE1Q04724 770 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 DSC1Q08554 894 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 BFSP2Q13515 415 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIF19Q2TAC6 998 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 LONRF3Q496Y0 759 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 STPG1Q5TH74 334 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP37Q86T82 979 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRTM3Q86VH5 581 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGSF21Q96ID5 467 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 LMX1BO60663 402 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATG13O75143 517 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 LILRA4P59901 499 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAF2Q12933 501 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC14A1Q13336 389 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 IQCB1Q15051 598 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNNM4Q6P4Q7 775 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 SKAP1Q86WV1 359 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 IZUMO1Q8IYV9 350 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM46DQ8NEK8 389 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 LMBR1Q8WVP7 490 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 DONSONQ9NYP3 566 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 HESX1Q9UBX0 185 aa1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLIC1O00299 241 aa1.77□□□□□ -2.13
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRKD3O94806 890 aa1.77□□□□□ -2.13
RNU6-187P-201ENST00000384139 GLUD1P00367 558 aa1.77□□□□□ -2.13
RNU6-187P-201ENST00000384139 GLUD2P49448 558 aa1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms