RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 SLF2Q8IX21 1173 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 EPS8L1Q8TE68 723 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 PBX2P40425 430 aa4.23□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.23□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.22□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 PRR7Q8TB68 274 aa4.22□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM34Q9BYJ4 488 aa4.22□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.22□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.22□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 HRO43593 1189 aa4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 BCAMP50895 628 aa4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 IRF5Q13568 498 aa4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 MORN1Q5T089 497 aa4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 NBPF3Q9H094 633 aa4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 TK2O00142 265 aa4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC4A3P48751 1232 aa4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP4CP60510 307 aa4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 NR6A1Q15406 480 aa4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 LRCH3Q96II8 777 aa4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 STAC3Q96MF2 364 aa4.2□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLGA8CPA6NN73 597 aa4.19□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 APLP1P51693 650 aa4.19□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 VAC14Q08AM6 782 aa4.19□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 KMT5BQ4FZB7 885 aa4.19□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 PRM3Q9NNZ6 103 aa4.19□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 SERPINA10Q9UK55 444 aa4.19□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.18□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR37L1O60883 481 aa4.18□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 RFX1P22670 979 aa4.18□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.18□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 GLMNQ92990 594 aa4.18□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.18□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa4.18□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 BRICD5Q6PL45 260 aa4.17□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 WNT2BQ93097 391 aa4.17□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 WBP1LQ9NX94 342 aa4.17□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 LYPD8Q6UX82 237 aa4.16□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 RETREG3Q86VR2 466 aa4.16□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 WWC1Q8IX03 1113 aa4.16□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKK1Q8NFD2 765 aa4.16□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 THAP11Q96EK4 314 aa4.16□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
SPTAN1-232ENST00000636483 SOCS7O14512 581 aa4.15□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 COPS2P61201 443 aa4.15□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 Q3C1V9 767 aa4.15□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 CDCA8Q53HL2 280 aa4.15□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 NECTIN2Q92692 538 aa4.15□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 ALG2Q9H553 416 aa4.15□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.15□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 CARNS1A5YM72 827 aa4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 WASHC4Q2M389 1173 aa4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PODXL2Q9NZ53 605 aa4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 MAP10Q9P2G4 905 aa4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEMA6NI47 508 aa4.13□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 CTHP32929 405 aa4.13□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PTPN5P54829 565 aa4.13□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 DESI1Q6ICB0 168 aa4.13□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 NR1I2O75469 434 aa4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 SEMA3FQ13275 785 aa4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF516Q92618 1163 aa4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 SPSB2Q99619 263 aa4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PRR14Q9BWN1 585 aa4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 TLL1O43897 1013 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXO45P0C2W1 286 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms