RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 POGKQ9P215 609 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 TESK2Q96S53 571 aa26.84■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 HSPA1LP34931 641 aa26.82■■□□□ 1.88
CTU2-204ENST00000564105 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.82■■□□□ 1.88
CTU2-204ENST00000564105 ILDR2Q71H61 639 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU2-204ENST00000564105 ADGRB2O60241 1585 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU2-204ENST00000564105 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CTU2-204ENST00000564105 SLC24A1O60721 1099 aa26.77■■□□□ 1.88
CTU2-204ENST00000564105 TMF1P82094 1093 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU2-204ENST00000564105 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU2-204ENST00000564105 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CTU2-204ENST00000564105 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CTU2-204ENST00000564105 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CTU2-204ENST00000564105 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CTU2-204ENST00000564105 EVC2Q86UK5 1308 aa26.7■■□□□ 1.87
CTU2-204ENST00000564105 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.7■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 TMEM94Q12767 1356 aa26.69■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 CCDC7Q96M83 1385 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 MYOM1P52179 1685 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 CDCA8Q53HL2 280 aa26.67■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.67■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.66■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 ITSN1Q15811 1721 aa26.66■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.65■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 C14orf37Q86TY3 774 aa26.65■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 CDK19Q9BWU1 502 aa26.64■■□□□ 1.86
CTU2-204ENST00000564105 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CTU2-204ENST00000564105 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CTU2-204ENST00000564105 USP32Q8NFA0 1604 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-204ENST00000564105 CABP2Q9NPB3 220 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-204ENST00000564105 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.6■■□□□ 1.85
CTU2-204ENST00000564105 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CTU2-204ENST00000564105 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.57■■□□□ 1.84
CTU2-204ENST00000564105 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.56■■□□□ 1.84
CTU2-204ENST00000564105 MSH6P52701 1360 aa26.55■■□□□ 1.84
CTU2-204ENST00000564105 ATP7BP35670 1465 aa26.55■■□□□ 1.84
CTU2-204ENST00000564105 DCCP43146 1447 aa26.54■■□□□ 1.84
CTU2-204ENST00000564105 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.53■■□□□ 1.84
CTU2-204ENST00000564105 NUTM2FA1L443 756 aa26.53■■□□□ 1.84
CTU2-204ENST00000564105 AKAP12Q02952 1782 aa26.53■■□□□ 1.84
CTU2-204ENST00000564105 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CTU2-204ENST00000564105 SOCS7O14512 581 aa26.51■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.51■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.51■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 ATF3P18847 181 aa26.5■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 TMC1Q8TDI8 760 aa26.5■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.48■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.47■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.46■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.46■■□□□ 1.83
CTU2-204ENST00000564105 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.45■■□□□ 1.82
CTU2-204ENST00000564105 MST1RQ04912 1400 aa26.44■■□□□ 1.82
CTU2-204ENST00000564105 CABP1Q9NZU7 370 aa26.44■■□□□ 1.82
CTU2-204ENST00000564105 KIF1AQ12756 1690 aa26.44■■□□□ 1.82
CTU2-204ENST00000564105 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.42■■□□□ 1.82
CTU2-204ENST00000564105 SLAIN2Q9P270 581 aa26.42■■□□□ 1.82
CTU2-204ENST00000564105 PANK3Q9H999 370 aa26.4■■□□□ 1.82
CTU2-204ENST00000564105 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.39■■□□□ 1.82
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.39■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.37■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.37■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.37■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.37■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 PHLPP1O60346 1717 aa26.36■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 A0A1W2PP64 1363 aa26.36■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.36■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.35■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 ORAI2Q96SN7 254 aa26.34■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 ACEP12821 1306 aa26.34■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.33■■□□□ 1.81
CTU2-204ENST00000564105 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.3■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.29■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.29■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms