RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	HSPA1L	P34931	641 aa		40.79	■■■■■ 4.12
PCNX1-206	ENST00000554292	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		40.78	■■■■■ 4.12
PCNX1-206	ENST00000554292	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		40.77	■■■■■ 4.12
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
PCNX1-206	ENST00000554292	PRAM1	Q96QH2	718 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PCNX1-206	ENST00000554292	POGK	Q9P215	609 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PCNX1-206	ENST00000554292	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		40.69	■■■■■ 4.1
PCNX1-206	ENST00000554292	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		40.68	■■■■■ 4.1
PCNX1-206	ENST00000554292	PHLPP1	O60346	1717 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PCNX1-206	ENST00000554292	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PCNX1-206	ENST00000554292	ADGRB2	O60241	1585 aa		40.66	■■■■■ 4.1
PCNX1-206	ENST00000554292	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	40.66	■■■■■ 4.1
PCNX1-206	ENST00000554292	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
PCNX1-206	ENST00000554292	BRINP3	Q76B58	766 aa		40.65	■■■■■ 4.1
PCNX1-206	ENST00000554292	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
PCNX1-206	ENST00000554292	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
PCNX1-206	ENST00000554292	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		40.58	■■■■■ 4.09
PCNX1-206	ENST00000554292	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		40.58	■■■■■ 4.09
PCNX1-206	ENST00000554292	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		40.57	■■■■■ 4.09
PCNX1-206	ENST00000554292	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		40.55	■■■■■ 4.08
PCNX1-206	ENST00000554292	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
PCNX1-206	ENST00000554292	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
PCNX1-206	ENST00000554292	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
PCNX1-206	ENST00000554292	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		40.53	■■■■■ 4.08
PCNX1-206	ENST00000554292	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
PCNX1-206	ENST00000554292	KIF1A	Q12756	1690 aa		40.48	■■■■■ 4.07
PCNX1-206	ENST00000554292	ORAI2	Q96SN7	254 aa		40.48	■■■■■ 4.07
PCNX1-206	ENST00000554292	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
PCNX1-206	ENST00000554292	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		40.47	■■■■■ 4.07
PCNX1-206	ENST00000554292	NUTM2F	A1L443	756 aa		40.47	■■■■■ 4.07
PCNX1-206	ENST00000554292	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		40.47	■■■■■ 4.07
PCNX1-206	ENST00000554292	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		40.47	■■■■■ 4.07
PCNX1-206	ENST00000554292	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		40.43	■■■■■ 4.06
PCNX1-206	ENST00000554292	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
PCNX1-206	ENST00000554292	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		40.42	■■■■■ 4.06
PCNX1-206	ENST00000554292	JCAD	Q9P266	1359 aa		40.41	■■■■■ 4.06
PCNX1-206	ENST00000554292	USP32	Q8NFA0	1604 aa		40.4	■■■■■ 4.06
PCNX1-206	ENST00000554292	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		40.38	■■■■■ 4.05
PCNX1-206	ENST00000554292	ITSN1	Q15811	1721 aa		40.37	■■■■■ 4.05
PCNX1-206	ENST00000554292	SHPRH	Q149N8	1683 aa		40.36	■■■■■ 4.05
PCNX1-206	ENST00000554292	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
PCNX1-206	ENST00000554292	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
PCNX1-206	ENST00000554292	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.05
PCNX1-206	ENST00000554292	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PCNX1-206	ENST00000554292	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	40.31	■■■■■ 4.04
PCNX1-206	ENST00000554292	CDK19	Q9BWU1	502 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PCNX1-206	ENST00000554292	FOXO3	O43524	673 aa		40.28	■■■■■ 4.04
PCNX1-206	ENST00000554292	ATP7B	P35670	1465 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PCNX1-206	ENST00000554292	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		40.26	■■■■■ 4.04
PCNX1-206	ENST00000554292	PXDN	Q92626	1479 aa		40.26	■■■■■ 4.03
PCNX1-206	ENST00000554292	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		40.23	■■■■■ 4.03
PCNX1-206	ENST00000554292	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		40.23	■■■■■ 4.03
PCNX1-206	ENST00000554292	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		40.22	■■■■■ 4.03
PCNX1-206	ENST00000554292	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
PCNX1-206	ENST00000554292	EVC2	Q86UK5	1308 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PCNX1-206	ENST00000554292	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
PCNX1-206	ENST00000554292	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PCNX1-206	ENST00000554292	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		40.17	■■■■■ 4.02
PCNX1-206	ENST00000554292	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		40.17	■■■■■ 4.02
PCNX1-206	ENST00000554292	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PCNX1-206	ENST00000554292	PSME1	Q06323	249 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PCNX1-206	ENST00000554292	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		40.14	■■■■■ 4.02
PCNX1-206	ENST00000554292	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	40.11	■■■■■ 4.01
PCNX1-206	ENST00000554292	CABP2	Q9NPB3	220 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PCNX1-206	ENST00000554292	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	40.11	■■■■■ 4.01
PCNX1-206	ENST00000554292	USP47	Q96K76	1375 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PCNX1-206	ENST00000554292	SBNO1	A3KN83	1393 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC24A1	O60721	1099 aa		40.07	■■■■■ 4.01
PCNX1-206	ENST00000554292	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4.01
PCNX1-206	ENST00000554292	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		40.06	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		40.06	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		40.06	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	40.05	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		40.04	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	LRP6	O75581	1613 aa		40.04	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		40.03	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		40.02	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	40.01	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	40.01	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	40.01	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	40.01	■■■■■ 4
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGEF10	O15013	1369 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PCNX1-206	ENST00000554292	ACE	P12821	1306 aa		39.98	■■■■□ 3.99
PCNX1-206	ENST00000554292	ALS2	Q96Q42	1657 aa		39.96	■■■■□ 3.99
PCNX1-206	ENST00000554292	TESK2	Q96S53	571 aa		39.95	■■■■□ 3.99
PCNX1-206	ENST00000554292	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		39.92	■■■■□ 3.98
PCNX1-206	ENST00000554292	CABP1	Q9NZU7	370 aa		39.92	■■■■□ 3.98
PCNX1-206	ENST00000554292	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	39.91	■■■■□ 3.98
PCNX1-206	ENST00000554292	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	39.89	■■■■□ 3.98
PCNX1-206	ENST00000554292	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	39.88	■■■■□ 3.97
PCNX1-206	ENST00000554292	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	39.88	■■■■□ 3.97
PCNX1-206	ENST00000554292	AKAP12	Q02952	1782 aa		39.87	■■■■□ 3.97
PCNX1-206	ENST00000554292	TMF1	P82094	1093 aa		39.85	■■■■□ 3.97
PCNX1-206	ENST00000554292	ABCA3	Q99758	1704 aa		39.85	■■■■□ 3.97
PCNX1-206	ENST00000554292	ADAMTS2	O95450	1211 aa		39.82	■■■■□ 3.97
PCNX1-206	ENST00000554292	USP6	P35125	1406 aa		39.82	■■■■□ 3.96
PCNX1-206	ENST00000554292	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	39.81	■■■■□ 3.96

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