RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 DLC1Q96QB1 1528 aa21.05■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 ATF3P18847 181 aa21.05■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.04■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 SLAIN2Q9P270 581 aa21.03■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.02■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.02■□□□□ 0.96
TSTA3-208ENST00000528920 POTEAQ6S8J7 498 aa21.01■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 TRAK1Q9UPV9 953 aa21■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.99■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 MST1RQ04912 1400 aa20.98■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 PRAM1Q96QH2 718 aa20.98■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.97■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 PHLPP1O60346 1717 aa20.96■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 POGKQ9P215 609 aa20.96■□□□□ 0.95
TSTA3-208ENST00000528920 JCADQ9P266 1359 aa20.95■□□□□ 0.94
TSTA3-208ENST00000528920 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.93■□□□□ 0.94
TSTA3-208ENST00000528920 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
TSTA3-208ENST00000528920 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.92■□□□□ 0.94
TSTA3-208ENST00000528920 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.92■□□□□ 0.94
TSTA3-208ENST00000528920 ADGRB2O60241 1585 aa20.92■□□□□ 0.94
TSTA3-208ENST00000528920 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
TSTA3-208ENST00000528920 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.9■□□□□ 0.94
TSTA3-208ENST00000528920 BRINP3Q76B58 766 aa20.9■□□□□ 0.94
TSTA3-208ENST00000528920 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.89■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 ORAI2Q96SN7 254 aa20.85■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.84■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 NUTM2FA1L443 756 aa20.84■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.83■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
TSTA3-208ENST00000528920 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.82■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 LRP6O75581 1613 aa20.82■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 USP32Q8NFA0 1604 aa20.82■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.81■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.81■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 KIF1AQ12756 1690 aa20.8■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.79■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSTA3-208ENST00000528920 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.76■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 SHPRHQ149N8 1683 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 CDK19Q9BWU1 502 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 ITSN1Q15811 1721 aa20.75■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.74■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 ATP7BP35670 1465 aa20.73■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 FOXO3O43524 673 aa20.72■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.72■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.71■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 PXDNQ92626 1479 aa20.71■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
TSTA3-208ENST00000528920 EVC2Q86UK5 1308 aa20.69■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 RXRBP28702 533 aa20.68■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.68■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 CABP2Q9NPB3 220 aa20.66■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.66■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 USP47Q96K76 1375 aa20.66■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.65■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 AFF2P51816 1311 aa20.65■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.65■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.65■□□□□ 0.9
TSTA3-208ENST00000528920 PSME1Q06323 249 aa20.63■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.62■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 C8orf37Q96NL8 207 aa20.62■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 TESK2Q96S53 571 aa20.62■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.61■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.61■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 SBNO1A3KN83 1393 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 SLC24A1O60721 1099 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 ACEP12821 1306 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-208ENST00000528920 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.58■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.58■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 CABP1Q9NZU7 370 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 ALS2Q96Q42 1657 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 ADAMTS2O95450 1211 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms