RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516208.1

RNU6-1194P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1194, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1194P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GSK3AP49840 483 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TRIM32Q13049 653 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 THAP11Q96EK4 314 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PHOX2BQ99453 314 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NUTM2FA1L443 756 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GPR37O15354 613 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MORN1Q5T089 497 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TRIM46Q7Z4K8 759 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HLA-CQ95604 372 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 WDR70Q9NW82 654 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ALDH1A1P00352 501 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FUT2Q10981 343 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KCNMA1Q12791 1236 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NPAS3Q8IXF0 933 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RDH13Q8NBN7 331 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GDF11O95390 407 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ATP6V1AP38606 617 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RSPH4AQ5TD94 716 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 BRICD5Q6PL45 260 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMEM151AQ8N4L1 468 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PXYLP1Q8TE99 480 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SOBPA7XYQ1 873 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SKOR1P84550 965 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RASSF7Q02833 373 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MSS51Q4VC12 460 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CCDC24Q8N4L8 307 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZFP42Q96MM3 310 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DDX11L8A8MPP1 907 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GUCA2AQ02747 115 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 XP32Q5T750 250 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 OATP04181 439 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GCGRP47871 477 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MMP16P51512 607 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GPAT2Q6NUI2 795 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 WASF2Q9Y6W5 498 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SIAH2O43255 324 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FCHSD2O94868 740 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 VSIG8P0DPA2 414 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 WNT7BP56706 349 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DXOO77932 396 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 EHBP1Q8NDI1 1231 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ADAMTS8Q9UP79 889 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IRS1P35568 1242 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KRT76Q01546 638 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 Q3C1V9 767 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GNPATO15228 680 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PPFIA3O75145 1194 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SCARF1Q14162 830 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GRIPAP1Q4V328 841 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TLL2Q9Y6L7 1015 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MAN1A2O60476 641 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IGHA1P01876 353 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SH3BP2P78314 561 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NNTQ13423 1086 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HIC1Q14526 733 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 C6orf118Q5T5N4 469 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SULF1Q8IWU6 871 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TIMP2P16035 220 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 WDR4P57081 412 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LINC01559Q495D7 138 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SVOPQ8N4V2 548 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 WHAMMQ8TF30 809 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NUDT12Q9BQG2 462 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ADAM23O75077 832 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KDM4AO75164 1064 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CD46P15529 392 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 JUNDP17535 347 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms