RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRSS12P56730 875 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR14Q9BWN1 585 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRBA1A5PL33 1030 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K9P80192 1104 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUDT18Q6ZVK8 323 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 STK25O00506 426 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 FZD5Q13467 585 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYPD4Q6UWN0 246 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 HDGFP51858 240 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARTNQ5T4W7 220 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM32Q13049 653 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFP64Q9NPA5 681 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHF20L1A8MW92 1017 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCUBE3Q8IX30 993 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPSB2Q99619 263 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 NR1I2O75469 434 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SKOR1P84550 965 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 FKBP8Q14318 412 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 FMNL2Q96PY5 1086 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC13Q8NBP0 860 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRDM9Q9NQV7 894 aa3.05□□□□□ -1.92
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SIAH2O43255 324 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALDH1A1P00352 501 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 THAP11Q96EK4 314 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEMA6BQ9H3T3 888 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K7O43318 606 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 MCTP1Q6DN14 999 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAMTS2O95450 1211 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL8A1P27658 744 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 MFSD10Q14728 455 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX12PQ92771 950 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 EYA1Q99502 592 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 CFHP08603 1231 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAOK2Q9UL54 1235 aa3.01□□□□□ -1.93
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CERKQ8TCT0 537 aa3□□□□□ -1.93
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RNU6-871P-201ENST00000516122 JAG1P78504 1218 aa2.99□□□□□ -1.93
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RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K10Q02779 954 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCARF1Q14162 830 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDHR5Q9HBB8 845 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIMP2P16035 220 aa2.97□□□□□ -1.93
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RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC4A3P48751 1232 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 WNT7BP56706 349 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 GAS6Q14393 721 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD163Q86VB7 1156 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHRNA4P43681 627 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP1-1Q07627 177 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOC2BQ14184 412 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PODNQ7Z5L7 613 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTSQ03393 145 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PADI6Q6TGC4 694 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM134Q9H6X4 195 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ENAMQ9NRM1 1142 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 WASF2Q9Y6W5 498 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPYSL4O14531 572 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAX4O43316 350 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRP8Q14114 963 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 MSS51Q4VC12 460 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 NKAPLQ5M9Q1 402 aa2.93□□□□□ -1.94
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