RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 AP1G2O75843 785 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 MTMR2Q13614 643 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 TRAK2O60296 914 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L8P0C7I0 530 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 MMRN1Q13201 1228 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 STAC3Q96MF2 364 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 PRR14Q9BWN1 585 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 COG6Q9Y2V7 657 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 RAD21O60216 631 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 MORN1Q5T089 497 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 ARXQ96QS3 562 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 CFAP99D6REC4 459 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 C6orf229H3BNL8 230 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 BCAMP50895 628 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 WNT2BQ93097 391 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 ARID3CA6NKF2 412 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 APBB1O00213 710 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 APLP1P51693 650 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 PPP4CP60510 307 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 Q3C1V9 767 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 RETREG3Q86VR2 466 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-205ENST00000391970 PRR7Q8TB68 274 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 TSC1Q92574 1164 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 WBP1LQ9NX94 342 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 HOMEZQ8IX15 550 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 NR1I2O75469 434 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 ABL2P42684 1182 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 DESI1Q6ICB0 168 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 BRICD5Q6PL45 260 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 THAP11Q96EK4 314 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 GPR37L1O60883 481 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 WWC1Q8IX03 1113 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 ARID3AQ99856 593 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 IRF5Q13568 498 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-205ENST00000391970 LYPD8Q6UX82 237 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 NR6A1Q15406 480 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 MSS51Q4VC12 460 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 POM121CA8CG34 1229 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 JUNDP17535 347 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 COPS2P61201 443 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 PTPRNQ16849 979 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 WASHC4Q2M389 1173 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 SPSB2Q99619 263 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 TLL1O43897 1013 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 GLMNQ92990 594 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 MTRQ99707 1265 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 ZPR1O75312 459 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 MMP16P51512 607 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 PTPN5P54829 565 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 PNMA1Q8ND90 353 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-205ENST00000391970 ADH1BP00325 375 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 VAC14Q08AM6 782 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 MAP10Q9P2G4 905 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-205ENST00000391970 TJAP1Q5JTD0 557 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 464.1 ms