RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 MTRQ99707 1265 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 MTMR2Q13614 643 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 BRICD5Q6PL45 260 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 RETREG3Q86VR2 466 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 SOCS7O14512 581 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZPR1O75312 459 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 HRCP23327 699 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 QPCTQ16769 361 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 MSS51Q4VC12 460 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 DESI1Q6ICB0 168 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADH1BP00325 375 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 RFC5P40937 340 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 COPS2P61201 443 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 IFFO2Q5TF58 517 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 C6orf229H3BNL8 230 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 BANK1Q8NDB2 785 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPSB2Q99619 263 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 CFAP99D6REC4 459 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 MMP16P51512 607 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 KCNC4Q03721 635 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRR7Q8TB68 274 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 TLL1O43897 1013 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 JUNDP17535 347 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 FLIIQ13045 1269 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF516Q92618 1163 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 USP17L8P0C7I0 530 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 MCM6Q14566 821 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTPRNQ16849 979 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 LYPD8Q6UX82 237 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 APBB1O00213 710 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 AP1G2O75843 785 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 S1PR4O95977 384 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 GGCXP38435 758 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 TSC1Q92574 1164 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 SNRKQ9NRH2 765 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 A0A0G2JS52 829 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 RNF223E7ERA6 249 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 KCNH2Q12809 1159 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 PNMA1Q8ND90 353 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 A6NJR5 290 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPR37L1O60883 481 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 RPIAP49247 311 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAP10Q9P2G4 905 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 COG6Q9Y2V7 657 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 NR6A1Q15406 480 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 NBPF14Q5TI25 921 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 CTHP32929 405 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-641P-201ENST00000384006 RAD21O60216 631 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-641P-201ENST00000384006 RGS20O76081 388 aa6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms