RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 BCAR3O75815 825 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD1-201ENST00000331462 WWC1Q8IX03 1113 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3C2BO00750 1634 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 GLI2P10070 1586 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 MORC1Q86VD1 984 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 NEFMP07197 916 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 CD109Q6YHK3 1445 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 NSD2O96028 1365 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 RUNDC1Q96C34 613 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 AAMPQ13685 434 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC27Q2M243 656 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 WDR63Q8IWG1 891 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRB2O60241 1585 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 NEO1Q92859 1461 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 IGHDP01880 384 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 RGS3P49796 1198 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 EVC2Q86UK5 1308 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP53Q96M91 514 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 ZFYVE9O95405 1425 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 GGT6Q6P531 493 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 ZMYM3Q14202 1370 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 MTHFSP49914 203 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 PANK1Q8TE04 598 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 COG6Q9Y2V7 657 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC11Q96J66 1382 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 NFKBIBQ15653 356 aa29■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 USP19O94966 1318 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 NEUROD2Q15784 382 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 MED14O60244 1454 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 SLC4A3P48751 1232 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 RICTORQ6R327 1708 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP1Q9C000 1473 aa28.95■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PP64 1363 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 RLBP1P12271 317 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRMP28827 1452 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 CABP2Q9NPB3 220 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 IDI1Q13907 227 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 GSE1Q14687 1217 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 RAPGEF3O95398 923 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 TNNQ9UQP3 1299 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 IL16Q14005 1332 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 SEC24BO95487 1268 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms