RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 DISP1Q96F81 1524 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 WDR63Q8IWG1 891 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 ASXL2Q76L83 1435 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 EVA1CP58658 441 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-202ENST00000320031 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 PANK1Q8TE04 598 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 PDE3AQ14432 1141 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 ABTB2Q8N961 1025 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 IDI1Q13907 227 aa20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 ST18O60284 1047 aa20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 SAMD9Q5K651 1589 aa20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.41■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.41■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.4■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.4■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.4■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 NOS1P29475 1434 aa20.4■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
ITGA3-202ENST00000320031 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.38■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.38■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 NECTIN2Q92692 538 aa20.38■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 PLCB2Q00722 1185 aa20.37■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 RILPL2Q969X0 211 aa20.37■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 A2MP01023 1474 aa20.36■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 FCHSD2O94868 740 aa20.36■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 ABCC2Q92887 1545 aa20.36■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.36■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.36■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 GSE1Q14687 1217 aa20.35■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.35■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 REC8O95072 547 aa20.35■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ITGA3-202ENST00000320031 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.33■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.32■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.32■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 BCAR3O75815 825 aa20.32■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.32■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.32■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 SLFN5Q08AF3 891 aa20.32■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.31■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 LNPKQ9C0E8 428 aa20.31■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.31■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.31■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 WWC1Q8IX03 1113 aa20.31■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF428Q96B54 188 aa20.3■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.3■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 NSD2O96028 1365 aa20.3■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 ADGRL2O95490 1459 aa20.29■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 GNAI3P08754 354 aa20.29■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.29■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.29■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 MSH5O43196 834 aa20.28■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 NRDCO43847 1150 aa20.28■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.27■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ITGA3-202ENST00000320031 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
ITGA3-202ENST00000320031 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.27■□□□□ 0.83
ITGA3-202ENST00000320031 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ITGA3-202ENST00000320031 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ITGA3-202ENST00000320031 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
ITGA3-202ENST00000320031 NFE2L2Q16236 605 aa20.26■□□□□ 0.83
ITGA3-202ENST00000320031 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.26■□□□□ 0.83
ITGA3-202ENST00000320031 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ITGA3-202ENST00000320031 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ITGA3-202ENST00000320031 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms