RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 PDCP20941 246 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 RUFY1Q96T51 708 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 CCP110O43303 1012 aa22.95■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 IFT57Q9NWB7 429 aa22.94■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 PDE3AQ14432 1141 aa22.93■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 GNAI3P08754 354 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 LNPKQ9C0E8 428 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 OLFM4Q6UX06 510 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 APPP05067 770 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 RABEP1Q15276 862 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 HIP1O00291 1037 aa22.91■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 PDE4CQ08493 712 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 XBP1P17861 261 aa22.9■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.89■■□□□ 1.26
UBE2N-201ENST00000318066 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.89■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 GCC1Q96CN9 775 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 TRAK2O60296 914 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 CNTROBQ8N137 903 aa22.88■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.87■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC66A2RUB6 948 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 SDF4Q9BRK5 362 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 NUTM2FA1L443 756 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 DCTN1Q14203 1278 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 MYO6Q9UM54 1294 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
UBE2N-201ENST00000318066 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.83■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 VPS37DQ86XT2 251 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 EVA1CP58658 441 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 TSPY26PQ9H489 355 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 KINO60870 393 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 PANK1Q8TE04 598 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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UBE2N-201ENST00000318066 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 SMARCE1Q969G3 411 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 TRIM5Q9C035 493 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 HFM1A2PYH4 1435 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 IL27Q8NEV9 243 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2N-201ENST00000318066 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 JMYQ8N9B5 988 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 OFD1O75665 1012 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 IGF1RP08069 1367 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 ANKRD1Q15327 319 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 PSME1Q06323 249 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 NEK4P51957 841 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 FSD1Q9BTV5 496 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF428Q96B54 188 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 WASHC4Q2M389 1173 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 PPP2R1AP30153 589 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 WDR63Q8IWG1 891 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2N-201ENST00000318066 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2N-201ENST00000318066 TXLNAP40222 546 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2N-201ENST00000318066 MTHFSP49914 203 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2N-201ENST00000318066 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC192P0DO97 292 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2N-201ENST00000318066 BACH2Q9BYV9 841 aa22.7■■□□□ 1.22
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