RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317096.8

PARL-202, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-202ENST00000317096 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
PARL-202ENST00000317096 MSH6P52701 1360 aa34.41■■■■□ 3.1
PARL-202ENST00000317096 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.4■■■■□ 3.1
PARL-202ENST00000317096 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.4■■■■□ 3.1
PARL-202ENST00000317096 PRAM1Q96QH2 718 aa34.38■■■■□ 3.09
PARL-202ENST00000317096 ADGRB2O60241 1585 aa34.38■■■■□ 3.09
PARL-202ENST00000317096 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.35■■■■□ 3.09
PARL-202ENST00000317096 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.35■■■■□ 3.09
PARL-202ENST00000317096 C14orf37Q86TY3 774 aa34.35■■■■□ 3.09
PARL-202ENST00000317096 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
PARL-202ENST00000317096 MST1RQ04912 1400 aa34.31■■■■□ 3.08
PARL-202ENST00000317096 HSPA1LP34931 641 aa34.3■■■■□ 3.08
PARL-202ENST00000317096 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.28■■■■□ 3.08
PARL-202ENST00000317096 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.27■■■■□ 3.08
PARL-202ENST00000317096 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.26■■■■□ 3.07
PARL-202ENST00000317096 POGKQ9P215 609 aa34.26■■■■□ 3.07
PARL-202ENST00000317096 USP32Q8NFA0 1604 aa34.26■■■■□ 3.07
PARL-202ENST00000317096 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.25■■■■□ 3.07
PARL-202ENST00000317096 SLAIN2Q9P270 581 aa34.23■■■■□ 3.07
PARL-202ENST00000317096 ATF3P18847 181 aa34.22■■■■□ 3.07
PARL-202ENST00000317096 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
PARL-202ENST00000317096 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.2■■■■□ 3.07
PARL-202ENST00000317096 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
PARL-202ENST00000317096 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.17■■■■□ 3.06
PARL-202ENST00000317096 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
PARL-202ENST00000317096 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.13■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.13■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.11■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 USP47Q96K76 1375 aa34.1■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 BRINP3Q76B58 766 aa34.1■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.09■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 ATP7BP35670 1465 aa34.08■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
PARL-202ENST00000317096 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.07■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 TESK2Q96S53 571 aa34.06■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 ORAI2Q96SN7 254 aa34.06■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 ITSN1Q15811 1721 aa34.06■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.06■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 NUTM2FA1L443 756 aa34.04■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.04■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 KIF1AQ12756 1690 aa34.03■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 PHLPP1O60346 1717 aa34.03■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 CDK19Q9BWU1 502 aa34.03■■■■□ 3.04
PARL-202ENST00000317096 ESCO1Q5FWF5 840 aa33.94■■■■□ 3.02
PARL-202ENST00000317096 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
PARL-202ENST00000317096 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
PARL-202ENST00000317096 EVC2Q86UK5 1308 aa33.92■■■■□ 3.02
PARL-202ENST00000317096 CABP2Q9NPB3 220 aa33.92■■■■□ 3.02
PARL-202ENST00000317096 PXDNQ92626 1479 aa33.91■■■■□ 3.02
PARL-202ENST00000317096 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
PARL-202ENST00000317096 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 PHF8Q9UPP1 1060 aa33.87■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 CCDC61Q9Y6R9 512 aa33.85■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 AKAP12Q02952 1782 aa33.84■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 FOXO3O43524 673 aa33.84■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
PARL-202ENST00000317096 PLEKHG3A1L390 1219 aa33.82■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa33.82■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 SHPRHQ149N8 1683 aa33.82■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.81■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 JCADQ9P266 1359 aa33.81■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 MYOM1P52179 1685 aa33.79■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 NPHP3Q7Z494 1330 aa33.79■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.78■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 ALS2Q96Q42 1657 aa33.77■■■■□ 3
PARL-202ENST00000317096 CD163L1Q9NR16 1453 aa33.76■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 MON2Q7Z3U7 1717 aa33.75■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 SLC24A1O60721 1099 aa33.74■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 CABP1Q9NZU7 370 aa33.74■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 ACEP12821 1306 aa33.73■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 TMF1P82094 1093 aa33.72■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 NRKQ7Z2Y5 1582 aa33.71■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
PARL-202ENST00000317096 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 KRT28Q7Z3Y7 464 aa33.7■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 SBNO1A3KN83 1393 aa33.68■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 SSH2Q76I76 1423 aa33.67■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 PNPLA6Q8IY17 1366 aa33.67■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.66■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.66■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.66■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.65■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 ABCA3Q99758 1704 aa33.64■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 USP6P35125 1406 aa33.64■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.64■■■□□ 2.98
PARL-202ENST00000317096 PSME1Q06323 249 aa33.63■■■□□ 2.97
PARL-202ENST00000317096 ILDR2Q71H61 639 aa33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms