RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638091.1

CACNB4-273, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,061 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-273	ENST00000638091	AP3B1	O00203	1094 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	APOE	P02649	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	VTN	P04004	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	YWHAQ	P27348	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PEX3	P56589	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SHC2	P98077	582 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CYB561D2	O14569	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	B3GAT3	O94766	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PAX7	P23759	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CA8	P35219	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	FLT3	P36888	993 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GCNT1	Q02742	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ICE2	Q659A1	982 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091		H3BM21	787 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PCDH17	O14917	1159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	KEL	P23276	732 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	AP2B1	P63010	937 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ARID5A	Q03989	594 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NR6A1	Q15406	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM3C	Q92520	227 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091		M0QYT0	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	FKBP9	O95302	570 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GCNT3	O95395	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	F13A1	P00488	732 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GGCX	P38435	758 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SP4	Q02446	784 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	TEX28	O15482	410 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ATP9B	O43861	1147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	EXOC3	O60645	756 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	OLFM2	O95897	454 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	RABGGTB	P53611	331 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SESN3	P58005	492 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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