RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542313.2

ULK1-206, Transcript of unc-51 like autophagy activating kinase 1, human

TSL 3

Gene ULK1, Length 307 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ULK1-206	ENST00000542313	SMO	Q99835	787 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	ANK1	P16157	1881 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313		A0A0A0MRY4	1105 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313		K7EQS6	105 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	AXIN1	O15169	862 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	COCH	O43405	550 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	BEST1	O76090	585 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	CYP17A1	P05093	508 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	ASPA	P45381	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	TUB	P50607	506 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	MAP3K7CL	P57077	242 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	PPP3CA	Q08209	521 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	INCA1	Q0VD86	236 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	DMC1	Q14565	340 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	ACD	Q96AP0	544 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	OTUB2	Q96DC9	234 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	PNKP	Q96T60	521 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	KRT82	Q9NSB4	513 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	EBF1	Q9UH73	591 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	TSC2	P49815	1807 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	CETN3	O15182	167 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	STX10	O60499	249 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	APBB3	O95704	486 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	ADH1C	P00326	375 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	FAM200B	P0CF97	657 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	TRIM49	P0CI25	452 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	CCDC192	P0DO97	292 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	CCDC130	P13994	396 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	SLC6A11	P48066	632 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	ORC1	Q13415	861 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	GAB4	Q2WGN9	574 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	KRT39	Q6A163	491 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	USP33	Q8TEY7	942 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	RTKN	Q9BST9	563 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	RMND1	Q9NWS8	449 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	GMIP	Q9P107	970 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	COL4A2	P08572	1712 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ULK1-206	ENST00000542313	CILP	O75339	1184 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	ADORA2B	P29275	332 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	GRIA2	P42262	883 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	NUCB2	P80303	420 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	GAD2	Q05329	585 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	BECN1	Q14457	450 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	C2orf27A	Q580R0	203 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	KBTBD6	Q86V97	674 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	TTC39C	Q8N584	583 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	WHAMM	Q8TF30	809 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	GSDMA	Q96QA5	445 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	HHIP	Q96QV1	700 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	TWNK	Q96RR1	684 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	NACA2	Q9H009	215 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	RAB20	Q9NX57	234 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	SCML2	Q9UQR0	700 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	HHLA1	C9JL84	531 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	TLR5	O60602	858 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	APOD	P05090	189 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ULK1-206	ENST00000542313	ADH5	P11766	374 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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