RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TAF5	Q15542	800 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NRN1L	Q496H8	165 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MZT2A	Q6P582	158 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KRT73	Q86Y46	540 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM136A	Q96C01	138 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAM2	Q99965	735 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CEP72	Q9P209	647 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FCHO1	O14526	889 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPDEF	O95238	335 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ERBB2	P04626	1255 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ITGA5	P08648	1049 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AR	P10275	920 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NPPB	P16860	134 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LAG3	P18627	525 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BMPR1A	P36894	532 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCT5	P48643	541 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PDE6C	P51160	858 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BCAT1	P54687	386 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CTSW	P56202	376 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FSTL1	Q12841	308 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GPS1	Q13098	491 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TP53BP2	Q13625	1128 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LY6K	Q17RY6	165 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC184	Q52MB2	194 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LIN54	Q6MZP7	749 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CXorf38	Q8TB03	319 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LPIN2	Q92539	896 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RUBCN	Q92622	972 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM227B	Q96M60	508 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NUDC	Q9Y266	331 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PBRM1	Q86U86	1689 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ROCK1	Q13464	1354 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAMTS12	P58397	1594 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADM5	C9JUS6	153 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784		M0R3H8	397 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AGPS	O00116	658 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PCDH17	O14917	1159 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DNPH1	O43598	174 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LPXN	O60711	386 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SNX2	O60749	519 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VNN1	O95497	513 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VIP	P01282	170 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C1S	P09871	688 aa		3.64	□□□□□ -1.83

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