RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439424.6

C17orf49-201, Transcript of chromosome 17 open reading frame 49, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C17orf49, Length 850 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf49-201ENST00000439424 TMEM176AQ96HP8 235 aa25.44■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 CHRDQ9H2X0 955 aa25.44■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 LMAN1LQ9HAT1 526 aa25.44■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 SP9P0CG40 484 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 IFNAR2P48551 515 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 MTAPQ13126 283 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 PDGFRLQ15198 375 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 TTC39CQ8N584 583 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 CCSER2Q9H7U1 834 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 COMMD8Q9NX08 183 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 PMM2O15305 246 aa25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 CYP26A1O43174 497 aa25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 COCHO43405 550 aa25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 LAMTOR5O43504 91 aa25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 GAS6Q14393 721 aa25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 EML3Q32P44 896 aa25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 SNX30Q5VWJ9 437 aa25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 LMO3Q8TAP4 145 aa25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 GNA14O95837 355 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 KCNH2Q12809 1159 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 Q6ZS52 159 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 KAT5Q92993 513 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 NT5C1BQ96P26 610 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 DUSP16Q9BY84 665 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 R4GN57 208 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 PROB1E7EW31 1015 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 ACO1P21399 889 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 HECTD3Q5T447 861 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 CPA6Q8N4T0 437 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 ATP2A3Q93084 1043 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 ECT2Q9H8V3 914 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 SCML2Q9UQR0 700 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 P4HA2O15460 535 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 GJA4P35212 333 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 TUBP50607 506 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 CCINQ13939 588 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 LRRC32Q14392 662 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 TSSK4Q6SA08 328 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 TTC30AQ86WT1 665 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 NMUR1Q9HB89 426 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 OSER1Q9NX31 292 aa25.39■■□□□ 1.66
C17orf49-201ENST00000439424 CCDC192P0DO97 292 aa25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 KIF11P52732 1056 aa25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 MLKLQ8NB16 471 aa25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 FBXO4Q9UKT5 387 aa25.38■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 EML5Q05BV3 1969 aa25.37■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 TLR5O60602 858 aa25.37■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.37■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.37■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 WBP2Q969T9 261 aa25.37■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 TSPAN16Q9UKR8 245 aa25.37■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 A0A1W2PQH9 124 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 TULP2O00295 520 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 TBX18O95935 607 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 CD19P15391 556 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 CETN1Q12798 172 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 SGO2Q562F6 1265 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 TMEM270Q6UE05 265 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 RRAGAQ7L523 313 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 IER2Q9BTL4 223 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 C2orf42Q9NWW7 574 aa25.36■■□□□ 1.65
C17orf49-201ENST00000439424 PRR23AA6NEV1 266 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.7 ms