RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298352.4

NGB-201, Transcript of neuroglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NGB, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGB-201ENST00000298352 TSPAN16Q9UKR8 245 aa27.57■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 TOMM70O94826 608 aa27.56■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 CD48P09326 243 aa27.56■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 PDGFRAP16234 1089 aa27.56■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 PDK2Q15119 407 aa27.56■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 PDIK1LQ8N165 341 aa27.56■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa27.56■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 RXFP2Q8WXD0 754 aa27.56■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 RBP3P10745 1247 aa27.55■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 GDF10P55107 478 aa27.55■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 SPARCL1Q14515 664 aa27.55■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.55■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 CYP2C9P11712 490 aa27.55■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 CDH6P55285 790 aa27.55■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 ROR1Q01973 937 aa27.55■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.55■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 UNC45BQ8IWX7 931 aa27.55■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 ADAMTS10Q9H324 1103 aa27.55■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 MLXIPLQ9NP71 852 aa27.55■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 HAS3O00219 553 aa27.54■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 ASMTLO95671 621 aa27.54■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 FLT3LGP49771 235 aa27.54■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 DPYSL3Q14195 570 aa27.54■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 MTFR1Q15390 333 aa27.54■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 RGS9BPQ6ZS82 235 aa27.54■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa27.54■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 CFAP73A6NFT4 308 aa27.53■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 KIZQ2M2Z5 673 aa27.53■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 PEBP4Q96S96 227 aa27.53■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
NGB-201ENST00000298352 ACSS3Q9H6R3 686 aa27.53■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 TMEM130Q8N3G9 435 aa27.52■■■□□ 2
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NGB-201ENST00000298352 TGM2P21980 687 aa27.51■■□□□ 1.99
NGB-201ENST00000298352 YARSP54577 528 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
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NGB-201ENST00000298352 RNF43Q68DV7 783 aa27.51■■□□□ 1.99
NGB-201ENST00000298352 ADGRD1Q6QNK2 874 aa27.51■■□□□ 1.99
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