RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J FYV4P38783 130 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J KNH1P50112 268 aa1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL193CP53097 103 aa1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR268CQ08734 132 aa1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J PPT2Q12036 173 aa1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR415CO13578 112 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J SCM4P32564 187 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J MID2P36027 376 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J GTT1P40582 234 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL190WP53872 204 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J DDR2P89113 61 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J HPA2Q06592 156 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J YLL006W-AQ3E814 58 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J QCR8P08525 94 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J CPR1P14832 162 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J HOT13P36078 116 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR041WP36134 250 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J EDC2P40023 145 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX17P40155 199 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPS12P53732 153 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J CMC4Q3E7A9 73 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J MBF1O14467 151 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J ARO2P28777 376 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL073CP40323 161 aa1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J YFR057WP43625 151 aa1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL257WQ08974 193 aa1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J KSH1Q8TGJ3 72 aa1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP5P09457 212 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J HAP3P13434 144 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J KRE1P17260 313 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR007CP25354 239 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J UGX2P32772 223 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL067CP39978 195 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR020W-AQ3E824 90 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YER039C-AP0CD97 72 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J COX10P21592 462 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J UBC11P52492 156 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J BSC4P53841 131 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J SEN15Q04675 128 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR007C-AQ07074 71 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL023C-AQ2V2P3 75 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL162W-AQ3E7A8 72 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR230W-AQ3E7B5 62 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL29P05747 59 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL44P19956 98 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J SSS1P35179 80 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR027CP38220 110 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J SPG1P50088 95 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR077CP53758 84 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU17Q12370 124 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR034C-AQ3E735 80 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR121W-AQ3E816 71 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL134C-AQ45U18 67 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J IGO2Q9P305 131 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL26AP05743 127 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC11P15367 167 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL33P20084 86 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J SPT4P32914 102 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YIA6P40556 373 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR085CP47131 105 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL26BP53221 127 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J TIM11P81449 96 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC21Q04772 201 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J MET32Q12041 191 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR230W-AQ3E762 66 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL127C-BQ3E828 52 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR139C-AO13536 103 aa1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J MSL1P40567 111 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J ICY1Q04329 127 aa1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J ISU2Q12056 156 aa1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YAL063C-AQ3E791 96 aa1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR236CA0A023PZG4 107 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J BET1P22804 142 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J FYV5P25585 152 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL044WP36092 106 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL230CP53074 147 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J RGM1Q00453 211 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J CNL1Q06333 122 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR072WQ08486 104 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL36BO14455 100 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU23Q07987 124 aa1.52□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL005CP38752 130 aa1.51□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J MPC3P53311 146 aa1.51□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J NAT5Q08689 176 aa1.51□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL157CQ12082 118 aa1.51□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR130CP38834 111 aa1.5□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL184CP53876 108 aa1.5□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J ELC1Q03071 99 aa1.5□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J DUT1P33317 147 aa1.49□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM18P40033 138 aa1.49□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J YML108WQ03759 105 aa1.49□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J COA6Q3E846 104 aa1.49□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J COX7P10174 60 aa1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J FUN14P18411 198 aa1.48□□□□□ -2.17
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