RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	YDL241W	Q07738	123 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YOL085C	Q99345	113 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	FUN14	P18411	198 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YHL005C	P38752	130 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YNR077C	P53758	84 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	EMC6	Q12431	108 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	BRP1	P53194	125 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YOR268C	Q08734	132 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	PRM3	Q08931	133 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	OST5	Q92316	86 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	KRE1	P17260	313 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	UTR5	P32630	166 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	TOM6	P33448	61 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YBR209W	P38311	105 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	ENV10	Q99382	181 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	SSS1	P35179	80 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	RSM18	P40033	138 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YPI1	P43587	155 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	DCV1	P43595	202 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RFU1	YLR073C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	YGL149W	P53116	101 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	YPR195C	Q06594	109 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	RRT15	Q3E811	62 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	SNN1	P48232	102 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	RTC6	O14464	93 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	PAU2	P32612	120 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	MPC2	P38857	129 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	RGM1	Q00453	211 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
RFU1	YLR073C	PAU12	P53343	120 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	DAD4	P69851	72 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	YOL118C	Q08259	102 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	PCC1	Q3E833	88 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	COX8	P04039	78 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	PAU19	P0CE85	124 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	SEC11	P15367	167 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	PAU3	P25610	124 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	YHR022C	P38763	256 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	ICY1	Q04329	127 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	RPB7	P34087	171 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	ATX1	P38636	73 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	YEL014C	P39999	101 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	AVO2	Q04749	426 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	PAU23	Q07987	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	PAU17	Q12370	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RFU1	YLR073C	ICS3	P47034	131 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	PAU16	P35994	123 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	PAU24	P38155	120 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	KRE9	P39005	276 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	PAU15	P40585	124 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	IMP2	P46972	177 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	HPA2	Q06592	156 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	ROX3	P25046	220 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	MRP17	P28778	131 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	MIC27	P50945	234 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	QCR8	P08525	94 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	AGA2	P32781	87 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	MRPS9	P38120	278 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	COX9	P07255	59 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	COX23	P38824	151 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	COX12	Q01519	83 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	YLR194C	Q05777	254 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	FIT2	Q08906	153 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	YBR027C	P38220	110 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	YBR292C	P38357	123 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	POR2	P40478	281 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RFU1	YLR073C	PFY1	P07274	126 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RFU1	YLR073C	YJL144W	P47009	104 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RFU1	YLR073C	CYT2	Q00873	224 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RFU1	YLR073C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RFU1	YLR073C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RFU1	YLR073C	LST8	P41318	303 aa		3	□□□□□ -1.93

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