RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C CDC43P18898 376 aa11.73□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C MRPS12P53732 153 aa11.73□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C YDR010CQ12426 110 aa11.73□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C RPL28P02406 149 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C YGL193CP53097 103 aa11.72□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C YLL006W-AQ3E814 58 aa11.72□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C SCS22Q6Q595 175 aa11.72□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C HAC1P41546 238 aa11.71□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C YML079WQ03629 201 aa11.71□□□□□ -0.53
YKL036CYKL036C YJL197C-AP0C5P0 93 aa11.7□□□□□ -0.54
YKL036CYKL036C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
YKL036CYKL036C YLR415CO13578 112 aa11.69□□□□□ -0.54
YKL036CYKL036C HYP2P23301 157 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
YKL036CYKL036C YIL134C-AQ45U18 67 aa11.68□□□□□ -0.54
YKL036CYKL036C YKL044WP36092 106 aa11.66□□□□□ -0.54
YKL036CYKL036C SEN15Q04675 128 aa11.66□□□□□ -0.54
YKL036CYKL036C KNH1P50112 268 aa11.65□□□□□ -0.54
YKL036CYKL036C YGL149WP53116 101 aa11.64□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C RPL29P05747 59 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C UBC11P52492 156 aa11.63□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C SEC11P15367 167 aa11.62□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C COA6Q3E846 104 aa11.62□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C IGO2Q9P305 131 aa11.62□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C YEL067CP39978 195 aa11.61□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C YPL073CP40323 161 aa11.61□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa11.61□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C MRPL44P19956 98 aa11.6□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C YNL190WP53872 204 aa11.6□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C UGX2P32772 223 aa11.59□□□□□ -0.55
YKL036CYKL036C UBC4P15731 148 aa11.57□□□□□ -0.56
YKL036CYKL036C HPA2Q06592 156 aa11.57□□□□□ -0.56
YKL036CYKL036C YER039C-AP0CD97 72 aa11.55□□□□□ -0.56
YKL036CYKL036C YLR156WP0CE96 114 aa11.55□□□□□ -0.56
YKL036CYKL036C YLR159WP0CE97 114 aa11.55□□□□□ -0.56
YKL036CYKL036C YLR161WP0CE98 114 aa11.55□□□□□ -0.56
YKL036CYKL036C YGL230CP53074 147 aa11.55□□□□□ -0.56
YKL036CYKL036C YNR077CP53758 84 aa11.54□□□□□ -0.56
YKL036CYKL036C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
YKL036CYKL036C ATP5P09457 212 aa11.52□□□□□ -0.57
YKL036CYKL036C YNL162W-AQ3E7A8 72 aa11.51□□□□□ -0.57
YKL036CYKL036C CPR1P14832 162 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
YKL036CYKL036C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
YKL036CYKL036C YOR268CQ08734 132 aa11.47□□□□□ -0.57
YKL036CYKL036C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
YKL036CYKL036C RPL26BP53221 127 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
YKL036CYKL036C SCM4P32564 187 aa11.45□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C YOR020W-AQ3E824 90 aa11.45□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C YFR057WP43625 151 aa11.43□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C DDR2P89113 61 aa11.43□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C MID2P36027 376 aa11.42□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C YPL257WQ08974 193 aa11.42□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C YIA6P40556 373 aa11.41□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C PAU17Q12370 124 aa11.41□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa11.41□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C ARO2P28777 376 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C YDL157CQ12082 118 aa11.4□□□□□ -0.58
YKL036CYKL036C SPG1P50088 95 aa11.39□□□□□ -0.59
YKL036CYKL036C CGR1P53188 120 aa11.39□□□□□ -0.59
YKL036CYKL036C COX10P21592 462 aa11.38□□□□□ -0.59
YKL036CYKL036C RGM1Q00453 211 aa11.37□□□□□ -0.59
YKL036CYKL036C YGR121W-AQ3E816 71 aa11.36□□□□□ -0.59
YKL036CYKL036C YCR007CP25354 239 aa11.35□□□□□ -0.59
YKL036CYKL036C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
YKL036CYKL036C ICY1Q04329 127 aa11.35□□□□□ -0.59
YKL036CYKL036C IRC21Q04772 201 aa11.35□□□□□ -0.59
YKL036CYKL036C YJR085CP47131 105 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
YKL036CYKL036C YBR230W-AQ3E762 66 aa11.33□□□□□ -0.6
YKL036CYKL036C KTI11Q3E840 82 aa11.33□□□□□ -0.6
YKL036CYKL036C YJL127C-BQ3E828 52 aa11.31□□□□□ -0.6
YKL036CYKL036C NAT5Q08689 176 aa11.29□□□□□ -0.6
YKL036CYKL036C FYV7Q12247 151 aa11.27□□□□□ -0.61
YKL036CYKL036C FUN14P18411 198 aa11.25□□□□□ -0.61
YKL036CYKL036C FYV5P25585 152 aa11.24□□□□□ -0.61
YKL036CYKL036C YHR130CP38834 111 aa11.22□□□□□ -0.61
YKL036CYKL036C KRE1P17260 313 aa11.21□□□□□ -0.61
YKL036CYKL036C BSC4P53841 131 aa11.2□□□□□ -0.62
YKL036CYKL036C ELC1Q03071 99 aa11.2□□□□□ -0.62
YKL036CYKL036C KSH1Q8TGJ3 72 aa11.19□□□□□ -0.62
YKL036CYKL036C YLR236CA0A023PZG4 107 aa11.18□□□□□ -0.62
YKL036CYKL036C YHR007C-AQ07074 71 aa11.14□□□□□ -0.63
YKL036CYKL036C MET32Q12041 191 aa11.14□□□□□ -0.63
YKL036CYKL036C ISU2Q12056 156 aa11.14□□□□□ -0.63
YKL036CYKL036C YOR034C-AQ3E735 80 aa11.14□□□□□ -0.63
YKL036CYKL036C PAU23Q07987 124 aa11.12□□□□□ -0.63
YKL036CYKL036C CMC4Q3E7A9 73 aa11.11□□□□□ -0.63
YKL036CYKL036C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
YKL036CYKL036C YOR072WQ08486 104 aa11.09□□□□□ -0.63
YKL036CYKL036C BET1P22804 142 aa11.04□□□□□ -0.64
YKL036CYKL036C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa11.04□□□□□ -0.64
YKL036CYKL036C YER181CP40097 107 aa11.01□□□□□ -0.65
YKL036CYKL036C YLR363W-AQ3E747 85 aa11□□□□□ -0.65
YKL036CYKL036C RPL36BO14455 100 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
YKL036CYKL036C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
YKL036CYKL036C YBR027CP38220 110 aa10.99□□□□□ -0.65
YKL036CYKL036C SFT1P43682 97 aa10.99□□□□□ -0.65
YKL036CYKL036C DUT1P33317 147 aa10.98□□□□□ -0.65
YKL036CYKL036C HOT13P36078 116 aa10.98□□□□□ -0.65
YKL036CYKL036C YHR139C-AO13536 103 aa10.96□□□□□ -0.65
YKL036CYKL036C MSA2P36157 363 aa10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.2 ms