RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C YDL022C-AP0C5L6 82 aa2.41□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YKR032WP36127 104 aa2.41□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C MDM35O60200 86 aa2.41□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.41□□□□□ -2.02not detected
DOA4YDR069C YOR376W-AQ3E805 51 aa2.41□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YGR035W-AQ45U48 73 aa2.41□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YOR268CQ08734 132 aa2.4□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C VPS68Q12016 184 aa2.4□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YLR342W-AQ3E810 57 aa2.4□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YER188C-AP0C0V2 99 aa2.4□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C FYV5P25585 152 aa2.4□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C PRM7Q12459 698 aa2.4□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YLR285C-AQ3E771 56 aa2.4□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C HMRA2P0CY13 119 aa2.39□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C MRPS12P53732 153 aa2.39□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YLR156WP0CE96 114 aa2.39□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YLR159WP0CE97 114 aa2.39□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YLR161WP0CE98 114 aa2.39□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C IRC21Q04772 201 aa2.39□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C OST5Q92316 86 aa2.39□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YBR209WP38311 105 aa2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C SHU1P38751 150 aa2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C UTH1P36135 365 aa2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C RPL26BP53221 127 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C TOM7P53507 60 aa2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YMR254CQ04838 102 aa2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YAL064WP39711 94 aa2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YMR122CQ03879 124 aa2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YOL014WQ08110 124 aa2.38□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C RPS23BP0CX30 145 aa2.37□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa2.37□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YLR236CA0A023PZG4 107 aa2.37□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YER135CP40082 130 aa2.37□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C DAD4P69851 72 aa2.37□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C RGM1Q00453 211 aa2.37□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C QCR8P08525 94 aa2.36□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C HSP150P32478 413 aa2.36□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C SED1Q01589 338 aa2.36□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YOR008C-AQ3E7B9 74 aa2.36□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C DDR48P18899 430 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.36□□□□□ -2.03not detected
DOA4YDR069C YOR020W-AQ3E824 90 aa2.36□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C QCR10P37299 77 aa2.35□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data2.35□□□□□ -2.03not detected
DOA4YDR069C NCE101Q02820 53 aa2.35□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C API2Q04413 109 aa2.35□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YMR244WQ04018 355 aa2.35□□□□□ -2.03
DOA4YDR069C YJR107C-AP0CT86 78 aa2.34□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YCR022CP25620 114 aa2.34□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C REE1P40893 198 aa2.34□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C LIP1Q03579 150 aa2.34□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YPR153WQ06537 140 aa2.34□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YJL197C-AP0C5P0 93 aa2.33□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YBL071CP38185 102 aa2.33□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C RRT1P38192 103 aa2.33□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YOR192C-CQ3E736 78 aa2.33□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YFR032C-BQ8TGU2 87 aa2.33□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C ATP18P81450 59 aa2.33□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YMR321CQ04898 105 aa2.33□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YBL008W-AQ3E821 79 aa2.33□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C HUB1Q6Q546 73 aa2.33□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C EDC1P53080 175 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C MRPS8Q03799 155 aa2.32□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YGL149WP53116 101 aa2.32□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C SOM1Q05676 74 aa2.32□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C ATP15P21306 62 aa2.32□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YJR146WP47174 117 aa2.32□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YMR141CP40211 102 aa2.31□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YIR020CP40575 100 aa2.31□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YNL190WP53872 204 aa2.31□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C TVP23P38962 199 aa2.31□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YAR023CD6VPM8 179 aa2.3□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C HUA1P40325 198 aa2.3□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C MRX7P53869 86 aa2.3□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C KRE9P39005 276 aa2.29□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YNL208WP40159 199 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C RPR2P40571 144 aa2.29□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YCR001WP25347 104 aa2.28□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YKL097CP34245 136 aa2.28□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C FYV12Q08559 129 aa2.28□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.28□□□□□ -2.04
DOA4YDR069C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C ATP17Q06405 101 aa2.27□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YFR009W-AP0C5M9 85 aa2.27□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C YCR095W-AQ3E787 52 aa2.27□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C BSC4P53841 131 aa2.27□□□□□ -2.05
DOA4YDR069C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
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