RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W YOL014WQ08110 124 aa3.95□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W YKR032WP36127 104 aa3.94□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W PCL5P38794 229 aa3.94□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W URM1P40554 99 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W API2Q04413 109 aa3.94□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W YLR194CQ05777 254 aa3.94□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa3.94□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W YGR035W-AQ45U48 73 aa3.93□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W MSA2P36157 363 aa3.93□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W QCR10P37299 77 aa3.93□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W YBL071CP38185 102 aa3.93□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W HMRA2P0CY13 119 aa3.92□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W RPS23BP0CX30 145 aa3.92□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W TOM7P53507 60 aa3.92□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W RGM1Q00453 211 aa3.92□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W MGR2Q02889 113 aa3.92□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W TRS23Q03784 219 aa3.92□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W SRL1Q08673 210 aa3.91□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W YPR153WQ06537 140 aa3.91□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W FYV12Q08559 129 aa3.91□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W COA3Q3E7B2 85 aa3.91□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W UTH1P36135 365 aa3.9□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W IRC19Q07843 230 aa3.9□□□□□ -1.78
CYK3YDL117W YCR043CP25361 127 aa3.89□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W RPR2P40571 144 aa3.89□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.89□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W FIT2Q08906 153 aa3.89□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YOR020W-AQ3E824 90 aa3.89□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YDR182W-AQ3E796 67 aa3.88□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YCR041WP37265 110 aa3.88□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W RRT1P38192 103 aa3.88□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YNL190WP53872 204 aa3.88□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W SOM1Q05676 74 aa3.88□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W PRM7Q12459 698 aa3.88□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W TVP23P38962 199 aa3.87□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YFL015CP43578 164 aa3.87□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W IRC21Q04772 201 aa3.87□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YBL008W-AQ3E821 79 aa3.87□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W ATP15P21306 62 aa3.86□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W LIP1Q03579 150 aa3.86□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YHL037CP38733 133 aa3.86□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W TOS6P48560 102 aa3.86□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YAR023CD6VPM8 179 aa3.85□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa3.85□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W HOT13P36078 116 aa3.85□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W SHU1P38751 150 aa3.85□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W KRE9P39005 276 aa3.85□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W YIR020CP40575 100 aa3.85□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W DAD4P69851 72 aa3.85□□□□□ -1.79
CYK3YDL117W SPC1P46965 94 aa3.84□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W HSP150P32478 413 aa3.83□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W REE1P40893 198 aa3.83□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W MRPS12P53732 153 aa3.83□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W YMR141CP40211 102 aa3.82□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W CCW14O13547 238 aa3.81□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa3.81□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W MRPS8Q03799 155 aa3.81□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa3.81□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W YJR107C-AP0CT86 78 aa3.79□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W YGL258W-AQ3E740 77 aa3.79□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data3.78□□□□□ -1.8not detected
CYK3YDL117W YMR244WQ04018 355 aa3.78□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W YOR034C-AQ3E735 80 aa3.78□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa3.78□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W COX23P38824 151 aa3.78□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W YCR095W-AQ3E787 52 aa3.78□□□□□ -1.8
CYK3YDL117W YDR010CQ12426 110 aa3.77□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W RPL38P49167 78 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YGL149WP53116 101 aa3.77□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W MRX7P53869 86 aa3.76□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.76□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YPL278CQ08990 100 aa3.76□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YJL197C-AP0C5P0 93 aa3.75□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YDL241WQ07738 123 aa3.75□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W BPH1P25356 2167 aa3.75□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W POR2P40478 281 aa3.75□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W SNA2P56508 79 aa3.75□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa3.74□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YLR236CA0A023PZG4 107 aa3.73□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W RTC6O14464 93 aa3.73□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YLR342W-AQ3E810 57 aa3.73□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W ATP18P81450 59 aa3.73□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W BSC4P53841 131 aa3.72□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YCR022CP25620 114 aa3.72□□□□□ -1.81
CYK3YDL117W YMR254CQ04838 102 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.4 ms