RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 SPATA18Q8TC71 538 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 VWCEQ96DN2 955 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 KCNK16Q96T55 309 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ESYT3A0FGR9 886 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 NRP1O14786 923 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 PARNO95453 639 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TUBBP07437 444 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TYMPP19971 482 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 MIPP30301 263 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 NDUFV1P49821 464 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 GUCY2DQ02846 1103 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 NPAS4Q8IUM7 802 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 RAPGEF5Q92565 580 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 PKMYT1Q99640 499 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 CNPY3Q9BT09 278 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TBKBP1A7MCY6 615 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TTI1O43156 1089 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 PHF2O75151 1096 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 RNF8O76064 485 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 CLTBP09497 229 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ATP11AP98196 1134 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 MFSD7Q6UXD7 560 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ANKLE1Q8NAG6 615 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 SLITRK1Q96PX8 696 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 OSBPL8Q9BZF1 889 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 EPB41L5Q9HCM4 733 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ARFGAP3Q9NP61 516 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TADA2AO75478 443 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 UPP2O95045 317 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ADCY1Q08828 1119 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ACAP1Q15027 740 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TRADDQ15628 312 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TTC27Q6P3X3 843 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 SLC26A9Q7LBE3 791 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 RCOR2Q8IZ40 523 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 THEM5Q8N1Q8 247 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 PEBP4Q96S96 227 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 MTUS1Q9ULD2 1270 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ARHGEF37A1IGU5 675 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 DPYSL4O14531 572 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 KRT10P13645 584 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 BDNFP23560 247 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 MCM3P25205 808 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 PBX3P40426 434 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 SLC11A1P49279 550 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ADCY2Q08462 1091 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 HADHQ16836 314 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 POLNQ7Z5Q5 900 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 C1orf54Q8WWF1 131 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 KCTD13Q8WZ19 329 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 LRRC4Q9HBW1 653 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 USP18Q9UMW8 372 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 LRRD1A4D1F6 860 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ERLIN1O75477 346 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 OR4Q2P0C623 313 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ITGB8P26012 769 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 SDC4P31431 198 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 KAZNQ674X7 775 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 CCDC26Q8TAB7 109 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 SMARCD1Q96GM5 515 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ADAM33Q9BZ11 813 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 GDF3Q9NR23 364 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 MARCH5Q9NX47 278 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 HOXA2O43364 376 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TKTL1P51854 596 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 CYP1B1Q16678 543 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 CNKSR3Q6P9H4 555 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 FAM172AQ8WUF8 416 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ATG4AQ8WYN0 398 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 RUBCNQ92622 972 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 TRIM51Q9BSJ1 452 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 GPR62Q9BZJ7 368 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ADAM28Q9UKQ2 775 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD10-201ENST00000249501 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120 ms