RNA–Protein interactions for RNA: YNR042W

YNR042W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNR042W, Length 429 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR042W	YNR042W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	PAU15	P40585	124 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	YGR149W	P48236	432 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	MRPS16	Q02608	121 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	ADD37	Q03233	198 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	PPT2	Q12036	173 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	YCR043C	P25361	127 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	DAD2	P36162	133 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	COX10	P21592	462 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	ACB1	P31787	87 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	UGX2	P32772	223 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	SDH8	P38345	138 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	YIL024C	P40543	189 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	GIM5	Q04493	163 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YNR042W	YNR042W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU1	P0CE88	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU14	P0CE89	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU6	P0CE90	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU18	P0CE91	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU8	P0CE92	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU11	P0CE93	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU13	P38725	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	ABF2	Q02486	183 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU10	Q03050	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU20	Q08322	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU9	Q3E770	120 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU7	P39545	55 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU5	P43575	122 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	SRB7	P47822	140 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	YEL045C	P32616	141 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PAU16	P35994	123 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	MVB12	P42939	101 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	ANT1	Q06497	328 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	YKR032W	P36127	104 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	HIT1	P46973	164 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	TAD2	P47058	250 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	DAN1	P47178	298 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	DDR2	P89113	61 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	QRI5	P32344	111 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	SHU1	P38751	150 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	HAP3	P13434	144 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	SRP21	P32342	167 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	SRP14	P38985	146 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
YNR042W	YNR042W	YHL005C	P38752	130 aa		2.58	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	SPC25	P40014	221 aa		2.58	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	DAD3	P69850	94 aa		2.58	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	YML108W	Q03759	105 aa		2.58	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	POM33	Q12164	279 aa		2.58	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	COX14	P39103	70 aa		2.57	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	DCN1	Q12395	269 aa		2.57	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	COX19	Q3E731	98 aa		2.57	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	COX7	P10174	60 aa		2.56	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	PET8	P38921	284 aa		2.56	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	PFY1	P07274	126 aa		2.55	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	TOA2	P32774	122 aa		2.55	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	SHG1	P38337	142 aa		2.55	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	UBC11	P52492	156 aa		2.55	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.55	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		2.55	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		2.54	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	POP7	P38291	140 aa		2.54	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	FYV12	Q08559	129 aa		2.54	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	YPL257W	Q08974	193 aa		2.54	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		2.54	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	HMRA1	P0CY11	126 aa		2.53	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		2.53	□□□□□ -2
YNR042W	YNR042W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	YBR027C	P38220	110 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	CGR1	P53188	120 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		2.52	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	TOS6	P48560	102 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	ATP16	Q12165	160 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		2.51	□□□□□ -2.01
YNR042W	YNR042W	ATP15	P21306	62 aa		2.5	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.2 ms