RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	YJL028W	P47062	111 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIN4	YMR138W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIN4	YMR138W	ERV14	P53173	138 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIN4	YMR138W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIN4	YMR138W	PBA1	Q05778	276 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIN4	YMR138W	RTC6	O14464	93 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	PAU16	P35994	123 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YAR029W	P39549	74 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	SSS1	P35179	80 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YEL008W	P40001	126 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	COA6	Q3E846	104 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	CNL1	Q06333	122 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YKL070W	P36087	169 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	AIM29	P36154	155 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	RPC10	P40422	70 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YIL059C	P40520	121 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YBR209W	P38311	105 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YBR219C	P38317	127 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YGL088W	P53151	121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	ENV10	Q99382	181 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	BET5	Q03630	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	SEN15	Q04675	128 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	DIF1	O13577	133 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	APS1	P35181	156 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CIN4	YMR138W	SEC11	P15367	167 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YAL065C	O13511	128 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YKL044W	P36092	106 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YER085C	P40058	173 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YDL241W	Q07738	123 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	ATP15	P21306	62 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	SVP26	P38869	228 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	COX14	P39103	70 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	HAC1	P41546	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YGL230C	P53074	147 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	CGR1	P53188	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	AIM11	P87275	137 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	FYV7	Q12247	151 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	ANB1	P19211	157 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YKR041W	P36134	250 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	SHU1	P38751	150 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	PEX17	P40155	199 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	GAT4	P40569	121 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	MRPL44	P19956	98 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YCR007C	P25354	239 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	TOA2	P32774	122 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	YAL064W	P39711	94 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	MRPS12	P53732	153 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIN4	YMR138W	QCR8	P08525	94 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	CIN5	P40917	295 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	PPT2	Q12036	173 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	MRP10	O75012	95 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	YEL067C	P39978	195 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	FUN14	P18411	198 aa		4	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
CIN4	YMR138W	YNR077C	P53758	84 aa		4	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	LCL2	Q08045	131 aa		4	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	STF1	P01098	86 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	YPL073C	P40323	161 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	SCM4	P32564	187 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	SMP1	P38128	452 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.98	□□□□□ -1.77	not detected
CIN4	YMR138W	NAT5	Q08689	176 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CIN4	YMR138W	YDR029W	Q12111	104 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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