RNA–Protein interactions for RNA: YML058W

SML1, Transcript of Ribonucleotide reductase inhibitor, yeast

Gene SML1, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SML1	YML058W	DAN1	P47178	298 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SML1	YML058W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SML1	YML058W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	PFY1	P07274	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	CNB1	P25296	175 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YAL064W	P39711	94 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YJR146W	P47174	117 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	OST3	P48439	350 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	TRP1	P00912	224 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	RPC10	P40422	70 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	ENV10	Q99382	181 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YEL008W	P40001	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	CIN5	P40917	295 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	NSE4	P43124	402 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	SNA2	P56508	79 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	MGR2	Q02889	113 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	PAU3	P25610	124 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YML108W	Q03759	105 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SML1	YML058W	YBR219C	P38317	127 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	YFL067W	P43537	175 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	TOS6	P48560	102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	LCL1	Q02786	101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	SMP1	P38128	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	ERV14	P53173	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	YAR029W	P39549	74 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	YGL118C	P53132	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	HHO1	P53551	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	CYT2	Q00873	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	APS1	P35181	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
SML1	YML058W	MMS2	P53152	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	PEX22	P39718	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	GTT1	P40582	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SML1	YML058W	ATP15	P21306	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	UIP3	P39547	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	YAL065C	O13511	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	YER134C	P40081	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	ECM12	O13529	151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	YDL241W	Q07738	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	ATP16	Q12165	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	YKL070W	P36087	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	CWP2	P43497	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	ARL3	Q02804	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	AQY2	P0CD90	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	AIM19	P40502	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SML1	YML058W	SHU1	P38751	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	COX14	P39103	70 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	OXA1	P39952	402 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	EOS1	P53938	366 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	TOA2	P32774	122 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	PAU16	P35994	123 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	ABF2	Q02486	183 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	PPT2	Q12036	173 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	AIM11	P87275	137 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SML1	YML058W	YDR010C	Q12426	110 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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