RNA–Protein interactions for RNA: YLR347C

KAP95, Transcript of Karyopherin beta, yeast

Gene KAP95, Length 2,586 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAP95	YLR347C	YAR068W	P39564	161 aa		2.64	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	PBA1	Q05778	276 aa		2.64	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		2.64	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	HUR1	P45820	110 aa		2.64	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	PIR1	Q03178	341 aa		2.64	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	TRS23	Q03784	219 aa		2.64	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YOR093C	Q12275	1648 aa		2.64	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	RIM15	P43565	1770 aa		2.64	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	CRC1	Q12289	327 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	STT4	P37297	1900 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	APC1	P53886	1748 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	QCR10	P37299	77 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	RRT1	P38192	103 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	IMP2	P46972	177 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	MPC3	P53311	146 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		2.63	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YEL073C	P39974	107 aa		2.62	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	SPG1	P50088	95 aa		2.62	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YHP1	Q04116	353 aa		2.62	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YPL261C	Q08976	102 aa		2.62	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.62	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YDL241W	Q07738	123 aa		2.62	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	PFY1	P07274	126 aa		2.61	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YCR022C	P25620	114 aa		2.61	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	CTR2	P38865	189 aa		2.61	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	SOM1	Q05676	74 aa		2.61	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YPL278C	Q08990	100 aa		2.61	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	RPR2	P40571	144 aa		2.61	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	SPC1	P46965	94 aa		2.61	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.61	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		2.6	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	MHF2	Q3E829	80 aa		2.6	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	YGL149W	P53116	101 aa		2.6	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	IRC23	Q08416	157 aa		2.6	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	UTH1	P36135	365 aa		2.59	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	LIP1	Q03579	150 aa		2.59	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	COX12	Q01519	83 aa		2.59	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	IRC19	Q07843	230 aa		2.59	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	UBR2	Q07963	1872 aa		2.59	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
KAP95	YLR347C	IML1	P47170	1584 aa		2.59	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YHR173C	P38864	112 aa		2.58	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PMD1	P32634	1753 aa		2.58	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	ROX3	P25046	220 aa		2.58	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	ERG2	P32352	222 aa		2.58	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YSY6	P38374	65 aa		2.58	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	BRP1	P53194	125 aa		2.58	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	SED1	Q01589	338 aa		2.58	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	BUD3	P25558	1636 aa		2.58	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	AGA2	P32781	87 aa		2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	RGM1	Q00453	211 aa		2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PIR3	Q03180	325 aa		2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	FSH2	Q05015	223 aa		2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YOR343C	Q12484	108 aa		2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	COX23	P38824	151 aa		2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	BSC1	Q12140	328 aa		2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.57	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU1	P0CE88	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU14	P0CE89	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU6	P0CE90	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU18	P0CE91	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU8	P0CE92	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU11	P0CE93	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YBL071C	P38185	102 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU13	P38725	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	MTC6	P38849	526 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU4	P53427	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU10	Q03050	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU20	Q08322	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PPT2	Q12036	173 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	PAU9	Q3E770	120 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	MIX17	Q03667	156 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YLR194C	Q05777	254 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	OST5	Q92316	86 aa		2.56	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YHR180W	P38868	163 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YIR020C	P40575	100 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YFL012W	P43580	148 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	MRPS8	Q03799	155 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	RTC6	O14464	93 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YFL051C	P43552	160 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	ECO1	P43605	281 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YML122C	Q03207	126 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YMR122C	Q03879	124 aa		2.55	□□□□□ -2
KAP95	YLR347C	YPR153W	Q06537	140 aa		2.55	□□□□□ -2

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