RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	YPL073C	P40323	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	MIC26	P50087	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	AIM34	Q03673	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	MRP49	P32388	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	PRY2	P36110	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	YKL070W	P36087	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	MPC2	P38857	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	VHS2	P40463	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	YBR144C	P34215	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	RRT13	P40042	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	YCH1	P42937	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	YFR035C	P43608	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	ELC1	Q03071	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIA40	YKL195W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YBR209W	P38311	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YJR146W	P47174	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	AIM11	P87275	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	MSA1	Q08471	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	ATP15	P21306	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	AIM29	P36154	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	PMP3	P87284	55 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	TRP1	P00912	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YKR041W	P36134	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YNL217W	P40152	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YGL088W	P53151	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YDR274C	P87283	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YIL059C	P40520	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	AGE2	P40529	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	PAI3	P01094	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	OXA1	P39952	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YER181C	P40097	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YFR057W	P43625	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YPS5	P53057	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	ANB1	P19211	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	PEX17	P40155	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YNR077C	P53758	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YCR001W	P25347	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YEL067C	P39978	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YEL008W	P40001	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YER085C	P40058	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	CIN5	P40917	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	COX12	Q01519	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIA40	YKL195W	UBC5	P15732	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	KRE9	P39005	276 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	YNL198C	P40166	100 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	SCW10	Q04951	389 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	SHU1	P38751	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
MIA40	YKL195W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
MIA40	YKL195W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	CDC43	P18898	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	UGX2	P32772	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	POP7	P38291	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	QCR8	P08525	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	MID2	P36027	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	YAR029W	P39549	74 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	MRPS12	P53732	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	YNL190W	P53872	204 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	SGF11	Q03067	99 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	VAM10	Q08474	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	CRC1	Q12289	327 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MIA40	YKL195W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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