RNA–Protein interactions for RNA: YHR196W

UTP9, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP9, Length 1,728 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP9	YHR196W	PAU2	P32612	120 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	SWM2	P40342	146 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	OST5	Q92316	86 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	DCV1	P43595	202 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	PAU3	P25610	124 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
UTP9	YHR196W	BRP1	P53194	125 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	YPR153W	Q06537	140 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UTP9	YHR196W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	BOL2	P53082	120 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.09	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	TOM6	P33448	61 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	PAU24	P38155	120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	RSM18	P40033	138 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YBR209W	P38311	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	DAD4	P69851	72 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YFL051C	P43552	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YPI1	P43587	155 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	ATX1	P38636	73 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YHL005C	P38752	130 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YFL012W	P43580	148 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	ICY1	Q04329	127 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	APC1	P53886	1748 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	PAU16	P35994	123 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	PAU15	P40585	124 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	CIS3	P47001	227 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	UTH1	P36135	365 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	RTC6	O14464	93 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	SEC11	P15367	167 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	RGM1	Q00453	211 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	MET31	Q03081	177 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UTP9	YHR196W	ICS3	P47034	131 aa		4.02	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.02	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	COX8	P04039	78 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	RPB7	P34087	171 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	SRX1	P36077	127 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YIR020C	P40575	100 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	AVO2	Q04749	426 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	VPS68	Q12016	184 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	MRPS9	P38120	278 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	KRE9	P39005	276 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	HPA2	Q06592	156 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	COX23	P38824	151 aa		4	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	PAU5	P43575	122 aa		4	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	PAU23	Q07987	124 aa		4	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	PAU17	Q12370	124 aa		4	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	GSC2	P40989	1895 aa		4	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	IMP2	P46972	177 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		3.99	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YBR292C	P38357	123 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	UTR5	P32630	166 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YHR022C	P38763	256 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YEL014C	P39999	101 aa		3.98	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	TOR1	P35169	2470 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	MIC27	P50945	234 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	RIM15	P43565	1770 aa		3.97	□□□□□ -1.77
UTP9	YHR196W	QCR8	P08525	94 aa		3.96	□□□□□ -1.78
UTP9	YHR196W	ROX3	P25046	220 aa		3.96	□□□□□ -1.78
UTP9	YHR196W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.96	□□□□□ -1.78
UTP9	YHR196W	FIT2	Q08906	153 aa		3.96	□□□□□ -1.78
UTP9	YHR196W	MYO1	P08964	1928 aa		3.96	□□□□□ -1.78
UTP9	YHR196W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
UTP9	YHR196W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
UTP9	YHR196W	VPS13	Q07878	3144 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UTP9	YHR196W	TAO3	P40468	2376 aa		3.95	□□□□□ -1.78
UTP9	YHR196W	HSP150	P32478	413 aa		3.95	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.2 ms