RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559389.1

SNX1-206, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 753 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-206ENST00000559389 BPIFB4P59827 614 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 NTHL1P78549 312 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 MTMR3Q13615 1198 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 MEA1Q16626 185 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 AAK1Q2M2I8 961 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 LEMD2Q8NC56 503 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 IQCDQ96DY2 449 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 CORO1BQ9BR76 489 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 ASAH2Q9NR71 780 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 NOTCH4Q99466 2003 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 HHLA1C9JL84 531 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 M0QYV0 167 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 MED7O43513 233 aa22.93■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 CYP11B1P15538 503 aa22.93■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.93■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 A0A1W2PQJ5 194 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 TNFRSF10BO14763 440 aa22.92■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 PDE6CP51160 858 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 KCNQ1P51787 676 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 SLC5A3P53794 718 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 PDE4CQ08493 712 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 MYRFLQ96LU7 910 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 IL21Q9HBE4 155 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 FAM50BQ9Y247 325 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 OBSL1O75147 1896 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 LRRC53A6NM62 1247 aa22.91■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 SLC8A3P57103 927 aa22.91■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 PLA2G4AP47712 749 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 ZNF75DP51815 510 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 TRIM14Q14142 442 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 TAF12Q16514 161 aa22.9■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 IL37Q9NZH6 218 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 EHD2Q9NZN4 543 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX1-206ENST00000559389 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
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SNX1-206ENST00000559389 TADA3O75528 432 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX1-206ENST00000559389 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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SNX1-206ENST00000559389 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX1-206ENST00000559389 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SNX1-206ENST00000559389 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX1-206ENST00000559389 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX1-206ENST00000559389 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX1-206ENST00000559389 ASB2Q96Q27 587 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX1-206ENST00000559389 COMMD8Q9NX08 183 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX1-206ENST00000559389 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX1-206ENST00000559389 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.88■■□□□ 1.25
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