RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 MZT2AQ6P582 158 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 USP49Q70CQ1 688 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SLC15A3Q8IY34 581 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SPARTQ8N0X7 666 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 MYCT1Q8N699 235 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SPATA5Q8NB90 893 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJB14Q8TBM8 379 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 FAM71BQ8TC56 605 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 CCT6BQ92526 530 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PPP2R3CQ969Q6 453 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM5Q9C035 493 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LUZP4Q9P127 313 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 HPSEQ9Y251 543 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ACKR2O00590 384 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PIP5K1BO14986 540 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 RGS10O43665 173 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TLR5O60602 858 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SPDEFO95238 335 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ITGA5P08648 1049 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF20P17024 532 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LAG3P18627 525 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SLC5A2P31639 672 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SERPINF1P36955 418 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PDE6CP51160 858 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ADAM17P78536 824 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SCAPQ12770 1279 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 FOXO1Q12778 655 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 EFEMP1Q12805 493 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PTK2BQ14289 1009 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 FAXCQ5TGI0 409 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 RNF207Q6ZRF8 634 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 STYXQ8WUJ0 223 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PPM1EQ8WY54 764 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 FAM136AQ96C01 138 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 FAM227BQ96M60 508 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 MAGEH1Q9H213 219 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 DACT1Q9NYF0 836 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LRFN1Q9P244 771 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 OR2W5A6NFC9 320 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 UNC119BA6NIH7 251 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM38O00635 465 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PPM1DO15297 605 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LPXNO60711 386 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PPFIA4O75335 1185 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 GLP2RO95838 553 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PEX11BO96011 259 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 C1SP09871 688 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SRGNP10124 158 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ARP10275 920 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 HGFP14210 728 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PPP3CBP16298 524 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ADORA2AP29274 412 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 BCAT1P54687 386 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 GUCY1B3Q02153 619 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TP53BP2Q13625 1128 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 CCNIQ14094 377 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 NRN1LQ496H8 165 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LIN54Q6MZP7 749 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 GPR149Q86SP6 731 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ABRAQ8N0Z2 381 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 CPXCR1Q8N123 301 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SSH3Q8TE77 659 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LENG9Q96B70 501 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SCLT1Q96NL6 688 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.1 ms