RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 GRK7Q8WTQ7 553 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PIK3R5Q8WYR1 880 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 SENP8Q96LD8 212 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC114Q96M63 670 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 RUFY1Q96T51 708 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 FMO2Q99518 471 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ADAM2Q99965 735 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 FAM118BQ9BPY3 351 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CNPY3Q9BT09 278 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 FRMPD3Q5JV73 1810 aa13.08□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 DPYSL4O14531 572 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 FKTNO75072 461 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CAND2O75155 1236 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 RNF8O76064 485 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TJP3O95049 919 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PDGFRAP16234 1089 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CLCNKBP51801 687 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ADCY2Q08462 1091 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PTK6Q13882 451 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 LHX8Q68G74 356 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TMC3Q7Z5M5 1100 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TRPV6Q9H1D0 765 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 RSAD1Q9HA92 442 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 VPS18Q9P253 973 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PCSK1NQ9UHG2 260 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0U1RQF3 1178 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PQY0 241 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CASTOR2A6NHX0 329 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 GABRDO14764 452 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 RNF40O75150 1001 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ATP2C2O75185 946 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PCK1P35558 622 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 HSD17B3P37058 310 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PLTPP55058 493 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC142Q17RM4 750 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TFDP3Q5H9I0 405 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 KCNT1Q5JUK3 1230 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 IQCKQ8N0W5 287 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 C3orf58Q8NDZ4 430 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ATL2Q8NHH9 583 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PGBD4Q96DM1 585 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 SH3GL2Q99962 352 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 SQORQ9Y6N5 450 aa13.07□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 OPA1O60313 960 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 GAS8O95995 478 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CKBP12277 381 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 KDELR1P24390 212 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 MTMR3Q13615 1198 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TAF5Q15542 800 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC14Q49A88 953 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 FBXO25Q8TCJ0 367 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PEBP4Q96S96 227 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 B3GNT5Q9BYG0 378 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CYLDQ9NQC7 956 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ASIC3Q9UHC3 531 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 LIASO43766 372 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PPFIA2O75334 1257 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 POMCP01189 267 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 SKIP12755 728 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 LCP1P13796 627 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 GYS2P54840 703 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TAZQ16635 292 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 RAB6CQ53S08 254 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TRAF7Q6Q0C0 670 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ECHDC2Q86YB7 292 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 FUKQ8N0W3 1084 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM86AQ8N2M4 240 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 SLC43A3Q8NBI5 491 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CLEC4CQ8WTT0 213 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 HSPH1Q92598 858 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 ART4Q93070 314 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 CFAP57Q96MR6 1250 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 TXLNGYQ9BZA5 131 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 RAB6CQ9H0N0 254 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 USP18Q9UMW8 372 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 PLAAQ9Y263 795 aa13.06□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ZNF548-201ENST00000336128 SDC4P31431 198 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.6 ms