RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 LEMD2Q8NC56 503 aa19.41■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 FLCNQ8NFG4 579 aa19.41■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 CPLX3Q8WVH0 158 aa19.41■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 ARID3AQ99856 593 aa19.41■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 GPR88Q9GZN0 384 aa19.41■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 CA14Q9ULX7 337 aa19.41■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 SNX9Q9Y5X1 595 aa19.41■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 F8VZ95 297 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 HUS1O60921 280 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 CLSTN1O94985 981 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 MYL4P12829 197 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 GJA1P17302 382 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 FCARP24071 287 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 KRT9P35527 623 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 GSDMDP57764 484 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 TNNC1P63316 161 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 NHLH1Q02575 133 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 TCF15Q12870 199 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 RAPGEF1Q13905 1077 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 LIMS2Q7Z4I7 341 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 TC2NQ8N9U0 490 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 SHKBP1Q8TBC3 707 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 SHC3Q92529 594 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 ZSWIM3Q96MP5 696 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 SPAG5Q96R06 1193 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 PRRX2Q99811 253 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 CYP3A43Q9HB55 503 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 TMLHEQ9NVH6 421 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 ASB3Q9Y575 518 aa19.4■□□□□ 0.7
PTX4-201ENST00000293922 PI15O43692 258 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ECI2O75521 394 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 AOC1P19801 751 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ACO1P21399 889 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 TUFMP49411 452 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 SMARCB1Q12824 385 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 SOWAHAQ2M3V2 549 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 FAM78AQ5JUQ0 283 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 TANGO2Q6ICL3 276 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 OSTM1Q86WC4 334 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 TMEM86AQ8N2M4 240 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 TOP6BLQ8N6T0 577 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 UBR7Q8N806 425 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 SPPL2BQ8TCT7 592 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 PSMG2Q969U7 264 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ASB16Q96NS5 453 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC7Q99615 494 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa19.39■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 LRRC53A6NM62 1247 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 GABRDO14764 452 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ATF6P18850 670 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 NUBP1P53384 320 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ADKP55263 362 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ARHGAP44Q17R89 818 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 MGAT5BQ3V5L5 792 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 DPH6Q7L8W6 267 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ADGRF2Q8IZF7 708 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 OR8K1Q8NGG5 319 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 SPATA18Q8TC71 538 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ELSPBP1Q96BH3 223 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 LPIN3Q9BQK8 851 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ACBD6Q9BR61 282 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 SMYD3Q9H7B4 428 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ARHGEF3Q9NR81 526 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ABHD10Q9NUJ1 306 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 CNTN6Q9UQ52 1028 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa19.38■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 A0A1W2PRU2 124 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 HCRTO43612 131 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 FAM163BP0C2L3 166 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 STAT1P42224 750 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 PTPN5P54829 565 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 TSPY1Q01534 308 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA8FQ08AF8 430 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 TEAD2Q15562 447 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 FMNL3Q8IVF7 1028 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 FAM71AQ8IYT1 594 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 TTC39CQ8N584 583 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 PANX2Q96RD6 677 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 MMS19Q96T76 1030 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 PKMYT1Q99640 499 aa19.37■□□□□ 0.69
PTX4-201ENST00000293922 SDCBP2Q9H190 292 aa19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms