RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MIA40	YKL195W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MIA40	YKL195W	YCR007C	P25354	239 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	MST28	P39552	234 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YGR025W	P53216	100 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YIP3	P53633	176 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	ATG39	Q06159	398 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	SCS22	Q6Q595	175 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	KEG1	P43614	200 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YJR096W	P47137	282 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YGL230C	P53074	147 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	CAX4	P53223	239 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YPL162C	Q12042	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YDL157C	Q12082	118 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	SEC11	P15367	167 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YCR023C	P25351	611 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YKR032W	P36127	104 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	PET8	P38921	284 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	SPI1	P40092	148 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	TVP18	Q04767	167 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	MHR1	Q06630	226 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	PRM3	Q08931	133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YPR013C	Q12145	317 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	PRM7	Q12459	698 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	HAP3	P13434	144 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	PCL2	P25693	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	APS1	P35181	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YCR041W	P37265	110 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YHR022C	P38763	256 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	ATP23	P53722	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	PAU23	Q07987	124 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	PAU17	Q12370	124 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	AGA1	P32323	725 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YER135C	P40082	130 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	CCW12	Q12127	133 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YOL085C	Q99345	113 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	SAL1	D6W196	494 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	MIG1	P27705	504 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YER076C	P40049	302 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	YDR042C	Q03205	200 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MIA40	YKL195W	PFY1	P07274	126 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	ELF1	P36053	145 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	UIP3	P39547	235 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	SIM1	P40472	476 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	CWC27	Q02770	301 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	VPS71	Q03433	280 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	BET5	Q03630	159 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	CCW14	O13547	238 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	Q0255	P03881	472 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	UTR5	P32630	166 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	MGR2	Q02889	113 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	AQY1	P0CD91	305 aa		5	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YCL042W	P25572	119 aa		5	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YDL186W	P48568	277 aa		5	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	GLO1	P50107	326 aa		5	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YMR103C	Q04436	120 aa		5	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	VAR1	P02381	398 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	MIG3	P39943	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	FIP1	P45976	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	ALG13	P53178	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YDR366C	P87287	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YKL044W	P36092	106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	TOS6	P48560	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YML079W	Q03629	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	DGA1	Q08650	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	DCV1	P43595	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	UBC11	P52492	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA40	YKL195W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 106.8 ms