RNA–Protein interactions for RNA: YJR055W

HIT1, Transcript of Protein involved in C/D snoRNP assembly, yeast

Gene HIT1, Length 495 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIT1	YJR055W	VAM10	Q08474	114 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	PRM3	Q08931	133 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	QCR6	P00127	147 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	PTC1	P35182	281 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	ETR1	P38071	380 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YGR269W	P40326	108 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	CIN5	P40917	295 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	DCV1	P43595	202 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YIP3	P53633	176 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	COX12	Q01519	83 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YDC1	Q02896	317 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	MAK3	Q03503	176 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	FCY1	Q12178	158 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	NMT1	P14743	455 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	NUF2	P33895	451 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YJR015W	P47090	510 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	LIP1	Q03579	150 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	SYM1	Q06563	197 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.47	□□□□□ -2.33
HIT1	YJR055W	KIN28	P06242	306 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	HYM1	P32464	399 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	UGX2	P32772	223 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	ECM31	P38122	312 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	NHP10	Q03435	203 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	THI74	Q04083	370 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	AVO2	Q04749	426 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.46	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	CSH1	P38287	376 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YGL193C	P53097	103 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YGL101W	P53144	215 aa		0.45	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	SPS2	P08459	502 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	MRS4	P23500	304 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YCR001W	P25347	104 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	TIM12	P32830	109 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YEL014C	P39999	101 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YGR017W	P53210	297 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	CSN9	Q03981	162 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	KEI1	Q06346	221 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	CCW12	Q12127	133 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	PAC10	P48363	199 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	SGF11	Q03067	99 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	GIM5	Q04493	163 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	COX5B	P00425	151 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	QCR2	P07257	368 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	ATP5	P09457	212 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YOR072W	Q08486	104 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YLR053C	Q12026	108 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YBR027C	P38220	110 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YGL230C	P53074	147 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	LCL1	Q02786	101 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	TMA23	Q03525	211 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RRT7	Q07829	113 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RFU1	Q08003	200 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	RDI1	Q12434	202 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HIT1	YJR055W	SPT14	P32363	452 aa		0.4	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	TOM7	P53507	60 aa		0.4	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	HSK3	P69852	69 aa		0.4	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	ATP19	P81451	68 aa		0.4	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
HIT1	YJR055W	YDL241W	Q07738	123 aa		0.4	□□□□□ -2.35

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