RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	MIG1	P27705	504 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	MST28	P39552	234 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YPR013C	Q12145	317 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	TOR1	P35169	2470 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YCR023C	P25351	611 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YHR022C	P38763	256 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	APS1	P35181	156 aa		6.4	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	UIP3	P39547	235 aa		6.4	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	CCW12	Q12127	133 aa		6.4	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YER076C	P40049	302 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	KEG1	P43614	200 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	CAX4	P53223	239 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	CWC27	Q02770	301 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	YDR042C	Q03205	200 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	VPS71	Q03433	280 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	TVP18	Q04767	167 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	PRM7	Q12459	698 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	UTR5	P32630	166 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	ELF1	P36053	145 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	MGR2	Q02889	113 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	PRM3	Q08931	133 aa		6.39	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	PFY1	P07274	126 aa		6.38	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	AGA1	P32323	725 aa		6.38	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	ATP23	P53722	227 aa		6.38	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	BET5	Q03630	159 aa		6.38	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	SAL1	D6W196	494 aa		6.37	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	YCR041W	P37265	110 aa		6.37	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	AQY1	P0CD91	305 aa		6.36	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	PCL2	P25693	308 aa		6.36	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	YER135C	P40082	130 aa		6.36	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	YOL085C	Q99345	113 aa		6.36	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	VAR1	P02381	398 aa		6.35	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		6.35	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		6.35	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	YKL044W	P36092	106 aa		6.34	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	YMR103C	Q04436	120 aa		6.34	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		6.34	□□□□□ -1.39
GGA2	YHR108W	TOS6	P48560	102 aa		6.34	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	Q0255	P03881	472 aa		6.33	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	SIM1	P40472	476 aa		6.33	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	GLO1	P50107	326 aa		6.33	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YMR244W	Q04018	355 aa		6.33	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YDR366C	P87287	132 aa		6.32	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YML079W	Q03629	201 aa		6.32	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		6.32	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		6.32	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	HMRA2	P0CY13	119 aa		6.31	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	MIG3	P39943	394 aa		6.31	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	DGA1	Q08650	418 aa		6.31	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YLR112W	Q12130	139 aa		6.31	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	FIP1	P45976	327 aa		6.31	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	MIC26	P50087	233 aa		6.31	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	MRPS8	Q03799	155 aa		6.31	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	CCW14	O13547	238 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	MRP49	P32388	137 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	ALG13	P53178	202 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YPL073C	P40323	161 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YKL070W	P36087	169 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	DCV1	P43595	202 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YDL186W	P48568	277 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	AIM34	Q03673	198 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	COA3	Q3E7B2	85 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	PRY2	P36110	329 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GGA2	YHR108W	YCL042W	P25572	119 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	YPL261C	Q08976	102 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	YLR042C	Q07990	161 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	YCH1	P42937	148 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	MPC2	P38857	129 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	YBR144C	P34215	104 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	RRT13	P40042	185 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	ELC1	Q03071	99 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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